More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_A1907 on replicon NC_007347
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  100 
 
 		 699 aa  1380    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  49.79 
 
 		 695 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  49.5 
 
 		 695 aa  595  1e-168  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  46.89 
 
 		 697 aa  577  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  49.34 
 
 		 697 aa  570  1e-161  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  45.91 
 
 		 702 aa  555  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  45.05 
 
 		 690 aa  493  9.999999999999999e-139  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  45.56 
 
 		 702 aa  479  1e-134  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  45.21 
 
 		 766 aa  334  3e-90  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  34.57 
 
 		 711 aa  317  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  35.73 
 
 		 710 aa  316  7e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  35.58 
 
 		 725 aa  314  3.9999999999999997e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  33.33 
 
 		 699 aa  310  4e-83  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  34.23 
 
 		 715 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  32.01 
 
 		 700 aa  304  4.0000000000000003e-81  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  34.23 
 
 		 700 aa  302  1e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  35.89 
 
 		 712 aa  301  3e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  34.37 
 
 		 703 aa  298  3e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  34.29 
 
 		 715 aa  293  6e-78  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.9 
 
 		 711 aa  291  3e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  33.05 
 
 		 750 aa  291  4e-77  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  34.88 
 
 		 698 aa  288  2e-76  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.52 
 
 		 697 aa  283  1e-74  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.64 
 
 		 696 aa  281  3e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.41 
 
 		 704 aa  277  6e-73  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 718 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 		 893 aa  272  1e-71  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.95 
 
 		 929 aa  272  2e-71  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  36.51 
 
 		 705 aa  269  1e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.2 
 
 		 911 aa  269  1e-70  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  30.14 
 
 		 707 aa  268  2e-70  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.45 
 
 		 700 aa  267  4e-70  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.48 
 
 		 692 aa  266  7e-70  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 708 aa  266  7e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  33.14 
 
 		 703 aa  266  8.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  31.51 
 
 		 698 aa  266  1e-69  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.57 
 
 		 700 aa  266  1e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.33 
 
 		 712 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.56 
 
 		 741 aa  263  8.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  32.77 
 
 		 893 aa  263  1e-68  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  33.38 
 
 		 703 aa  262  2e-68  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.39 
 
 		 892 aa  260  7e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  30.94 
 
 		 913 aa  259  1e-67  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.52 
 
 		 699 aa  259  1e-67  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  33.47 
 
 		 705 aa  258  3e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.75 
 
 		 712 aa  256  1.0000000000000001e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.85 
 
 		 706 aa  255  2.0000000000000002e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  33.89 
 
 		 699 aa  253  8.000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  30.3 
 
 		 669 aa  253  1e-65  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 701 aa  252  2e-65  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  30.52 
 
 		 920 aa  251  4e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  33.1 
 
 		 897 aa  249  1e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  30.2 
 
 		 708 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  32.3 
 
 		 897 aa  249  1e-64  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  28.25 
 
 		 708 aa  249  2e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  31.07 
 
 		 715 aa  248  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 		 715 aa  247  4.9999999999999997e-64  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.14 
 
 		 703 aa  247  6e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  30.96 
 
 		 892 aa  247  6.999999999999999e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.32 
 
 		 698 aa  246  8e-64  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  31.32 
 
 		 698 aa  246  8e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.37 
 
 		 697 aa  246  9e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  30.53 
 
 		 710 aa  246  9.999999999999999e-64  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.11 
 
 		 695 aa  246  9.999999999999999e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  32.86 
 
 		 705 aa  246  1.9999999999999999e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 704 aa  245  1.9999999999999999e-63  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.42 
 
 		 918 aa  244  3e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 711 aa  244  3.9999999999999997e-63  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 702 aa  244  3.9999999999999997e-63  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  27.03 
 
 		 702 aa  243  7.999999999999999e-63  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.38 
 
 		 706 aa  242  1e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  33.38 
 
 		 705 aa  241  2.9999999999999997e-62  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0520  CoA-binding domain-containing protein  32.45 
 
 		 911 aa  241  2.9999999999999997e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.76603 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  33.24 
 
 		 705 aa  241  4e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.14 
 
 		 727 aa  241  4e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.35 
 
 		 921 aa  239  1e-61  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 729 aa  238  2e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  28.45 
 
 		 696 aa  239  2e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  30.6 
 
 		 907 aa  238  3e-61  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  28.35 
 
 		 895 aa  238  4e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.93 
 
 		 912 aa  237  6e-61  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.13 
 
 		 709 aa  234  3e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  33.11 
 
 		 903 aa  234  6e-60  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  31.9 
 
 		 907 aa  232  2e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  28.67 
 
 		 711 aa  232  2e-59  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  33.47 
 
 		 898 aa  230  6e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  30.79 
 
 		 889 aa  228  3e-58  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  32.06 
 
 		 907 aa  228  3e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.94 
 
 		 711 aa  228  4e-58  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.81 
 
 		 915 aa  228  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  30.94 
 
 		 883 aa  227  5.0000000000000005e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  29.71 
 
 		 900 aa  227  5.0000000000000005e-58  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.44 
 
 		 699 aa  226  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  32.81 
 
 		 714 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  31.26 
 
 		 890 aa  225  2e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.88 
 
 		 905 aa  224  4e-57  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  33.15 
 
 		 716 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  31.36 
 
 		 696 aa  220  7e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  31.01 
 
 		 718 aa  219  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3477  CoA-binding domain-containing protein  33.19 
 
 		 707 aa  219  2e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.025154  normal  0.742177 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>