More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3774 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 714 aa  1371    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  39.26 
 
 		 699 aa  424  1e-117  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  36.95 
 
 		 750 aa  390  1e-107  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  35.57 
 
 		 700 aa  340  5e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  31.21 
 
 		 696 aa  338  2.9999999999999997e-91  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  35.85 
 
 		 712 aa  335  2e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  34.19 
 
 		 698 aa  335  2e-90  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  36.91 
 
 		 711 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.38 
 
 		 696 aa  329  1.0000000000000001e-88  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  32.45 
 
 		 707 aa  328  3e-88  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  29.37 
 
 		 701 aa  326  1e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  34.18 
 
 		 698 aa  325  2e-87  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  30.76 
 
 		 697 aa  321  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1700  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  33.52 
 
 		 699 aa  320  7e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  33.43 
 
 		 708 aa  318  2e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  31.79 
 
 		 669 aa  317  5e-85  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  34.47 
 
 		 704 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  32.59 
 
 		 704 aa  311  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.82 
 
 		 929 aa  309  1.0000000000000001e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  28.18 
 
 		 702 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  33.29 
 
 		 892 aa  307  4.0000000000000004e-82  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  30.51 
 
 		 711 aa  306  7e-82  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  32.29 
 
 		 698 aa  304  4.0000000000000003e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3495  CoA-binding domain-containing protein  35.73 
 
 		 711 aa  303  6.000000000000001e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244282 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  27.62 
 
 		 702 aa  303  8.000000000000001e-81  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.35 
 
 		 703 aa  301  2e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31.49 
 
 		 711 aa  301  3e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  33.61 
 
 		 700 aa  297  4e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  35.45 
 
 		 695 aa  296  1e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  33.85 
 
 		 715 aa  296  1e-78  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  31.7 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  33.8 
 
 		 700 aa  295  2e-78  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  30.43 
 
 		 706 aa  294  5e-78  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  31.81 
 
 		 699 aa  292  1e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  34.05 
 
 		 883 aa  291  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  33.1 
 
 		 710 aa  291  2e-77  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  30.08 
 
 		 712 aa  291  4e-77  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  32.78 
 
 		 704 aa  290  5.0000000000000004e-77  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  35.92 
 
 		 695 aa  290  5.0000000000000004e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  33.75 
 
 		 718 aa  290  5.0000000000000004e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  31.56 
 
 		 892 aa  290  8e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  34.81 
 
 		 712 aa  289  1e-76  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  33.43 
 
 		 715 aa  289  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.81 
 
 		 703 aa  288  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  32.81 
 
 		 697 aa  288  2.9999999999999996e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  34.86 
 
 		 692 aa  287  4e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.81 
 
 		 706 aa  287  5.999999999999999e-76  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6042  CoA-binding domain-containing protein  34.42 
 
 		 699 aa  286  8e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.29 
 
 		 714 aa  285  1.0000000000000001e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.75 
 
 		 711 aa  285  2.0000000000000002e-75  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2278  CoA-binding domain protein  32.08 
 
 		 698 aa  285  2.0000000000000002e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.244685  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  34.41 
 
 		 725 aa  284  5.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  31.96 
 
 		 911 aa  284  5.000000000000001e-75  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  35.07 
 
 		 703 aa  283  6.000000000000001e-75  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  33.43 
 
 		 708 aa  283  1e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  34.05 
 
 		 697 aa  278  2e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  29.62 
 
 		 905 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  34.94 
 
 		 741 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  29.94 
 
 		 697 aa  274  5.000000000000001e-72  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.62 
 
 		 889 aa  273  9e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  33.29 
 
 		 715 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.34 
 
 		 920 aa  271  2e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  29.99 
 
 		 895 aa  270  5.9999999999999995e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  31.36 
 
 		 897 aa  270  7e-71  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  31.63 
 
 		 702 aa  269  1e-70  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  36.02 
 
 		 904 aa  269  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  35.34 
 
 		 705 aa  268  2e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  29.58 
 
 		 695 aa  268  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.99 
 
 		 893 aa  268  2.9999999999999995e-70  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.72 
 
 		 698 aa  266  1e-69  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  31.67 
 
 		 728 aa  266  1e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  32.72 
 
 		 709 aa  265  2e-69  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  31.11 
 
 		 900 aa  263  6.999999999999999e-69  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  30.42 
 
 		 913 aa  263  1e-68  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  27.61 
 
 		 921 aa  261  2e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1637  CoA-binding domain protein  32.19 
 
 		 709 aa  262  2e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  35.01 
 
 		 716 aa  261  3e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  34.45 
 
 		 727 aa  261  3e-68  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28 
 
 		 915 aa  260  8e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  28.9 
 
 		 912 aa  259  9e-68  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.94 
 
 		 918 aa  259  1e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  33.05 
 
 		 715 aa  259  1e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3477  CoA-binding domain protein  31.93 
 
 		 699 aa  255  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.214779  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  30.97 
 
 		 893 aa  252  2e-65  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  32.6 
 
 		 690 aa  249  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1905  putative acyl-CoA synthetase  34.04 
 
 		 718 aa  249  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4811  CoA-binding domain-containing protein  33.56 
 
 		 693 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.441537  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  34.86 
 
 		 883 aa  243  7.999999999999999e-63  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  35.24 
 
 		 898 aa  240  6.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  31.47 
 
 		 903 aa  236  1.0000000000000001e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0296  CoA-binding domain protein  35.19 
 
 		 707 aa  236  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000033493 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  38.8 
 
 		 710 aa  234  5e-60  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  29.31 
 
 		 685 aa  233  1e-59  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  31.9 
 
 		 903 aa  233  1e-59  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4844  CoA-binding domain-containing protein  35.61 
 
 		 693 aa  230  7e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0385105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  32.22 
 
 		 708 aa  229  2e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  35.11 
 
 		 926 aa  229  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0336  CoA-binding domain-containing protein  34.77 
 
 		 508 aa  228  3e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  33.04 
 
 		 699 aa  228  4e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  26.87 
 
 		 898 aa  228  4e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>