More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_1760 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  51.51 
 
 
886 aa  911    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  51.51 
 
 
886 aa  914    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.51 
 
 
886 aa  912    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  79.78 
 
 
903 aa  1466    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  51.51 
 
 
886 aa  911    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  47.83 
 
 
904 aa  825    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  43.16 
 
 
893 aa  682    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  80.8 
 
 
899 aa  1458    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  80.24 
 
 
901 aa  1470    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  75.78 
 
 
896 aa  1411    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.4 
 
 
886 aa  916    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  51.18 
 
 
894 aa  910    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  51.73 
 
 
886 aa  917    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.51 
 
 
886 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  52.18 
 
 
880 aa  889    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  76.7 
 
 
898 aa  1414    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  46.24 
 
 
911 aa  786    Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  46.44 
 
 
913 aa  833    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.62 
 
 
886 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  45.54 
 
 
898 aa  769    Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.62 
 
 
886 aa  919    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  51.4 
 
 
886 aa  911    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  43 
 
 
890 aa  653    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  43.61 
 
 
903 aa  716    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  76.23 
 
 
896 aa  1406    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  43.76 
 
 
901 aa  691    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  51.62 
 
 
886 aa  914    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  70.5 
 
 
899 aa  1273    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  40.02 
 
 
897 aa  664    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  52.68 
 
 
882 aa  902    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  44.84 
 
 
893 aa  714    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  52.18 
 
 
880 aa  889    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  51.51 
 
 
886 aa  918    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
887 aa  920    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.51 
 
 
886 aa  914    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  41.35 
 
 
903 aa  638    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  80.24 
 
 
905 aa  1469    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  80.69 
 
 
901 aa  1472    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  81.05 
 
 
913 aa  1480    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  80.82 
 
 
913 aa  1477    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  75.45 
 
 
900 aa  1412    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  50 
 
 
877 aa  858    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  52.9 
 
 
882 aa  905    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  77.68 
 
 
900 aa  1450    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  52.4 
 
 
893 aa  922    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  40.09 
 
 
896 aa  674    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  80.94 
 
 
904 aa  1479    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  44.52 
 
 
897 aa  679    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  51.73 
 
 
886 aa  914    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  52.18 
 
 
880 aa  889    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  40.99 
 
 
900 aa  657    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  52.06 
 
 
882 aa  910    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  49.66 
 
 
877 aa  852    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  100 
 
 
911 aa  1874    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  50.5 
 
 
887 aa  881    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  52.29 
 
 
888 aa  909    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  80.8 
 
 
901 aa  1473    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  51.83 
 
 
897 aa  931    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272311 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  43.94 
 
 
898 aa  738    Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  38.44 
 
 
892 aa  633  1e-180  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  37.8 
 
 
895 aa  629  1e-178  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  38.7 
 
 
892 aa  627  1e-178  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  38.08 
 
 
915 aa  620  1e-176  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  38.47 
 
 
889 aa  616  1e-175  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  39.3 
 
 
929 aa  617  1e-175  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  40.31 
 
 
897 aa  619  1e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  38.23 
 
 
911 aa  612  9.999999999999999e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  37.78 
 
 
905 aa  607  9.999999999999999e-173  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  38.07 
 
 
915 aa  595  1e-169  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  39.78 
 
 
893 aa  592  1e-168  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  38.48 
 
 
899 aa  592  1e-167  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  37.09 
 
 
921 aa  587  1e-166  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  39.82 
 
 
902 aa  585  1.0000000000000001e-165  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  38.15 
 
 
887 aa  582  1.0000000000000001e-165  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  39.24 
 
 
907 aa  584  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1904  CoA-binding  36.24 
 
 
915 aa  580  1e-164  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  38.45 
 
 
920 aa  576  1.0000000000000001e-163  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  39.98 
 
 
907 aa  578  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  38.68 
 
 
897 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  37.12 
 
 
912 aa  578  1.0000000000000001e-163  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  37.71 
 
 
918 aa  574  1.0000000000000001e-162  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  40.2 
 
 
907 aa  572  1.0000000000000001e-162  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  39.31 
 
 
906 aa  558  1e-157  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  38.24 
 
 
903 aa  550  1e-155  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  36.7 
 
 
893 aa  548  1e-154  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  34.77 
 
 
908 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  34.77 
 
 
901 aa  506  9.999999999999999e-143  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
896 aa  505  1e-141  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  34.45 
 
 
892 aa  503  1e-141  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  33.77 
 
 
892 aa  506  1e-141  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  33.59 
 
 
895 aa  501  1e-140  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  34.49 
 
 
904 aa  498  1e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  34.19 
 
 
897 aa  499  1e-139  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  35.92 
 
 
918 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
900 aa  494  9.999999999999999e-139  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  36.88 
 
 
900 aa  490  1e-137  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  33.85 
 
 
918 aa  491  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  37.07 
 
 
900 aa  489  1e-137  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  34.69 
 
 
907 aa  484  1e-135  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  33.63 
 
 
886 aa  477  1e-133  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>