More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_6428 on replicon NC_012854
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  56.26 
 
 		 680 aa  700    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  54.08 
 
 		 679 aa  685    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  100 
 
 		 684 aa  1364    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  67.3 
 
 		 687 aa  828    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  87.43 
 
 		 684 aa  1158    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  43.12 
 
 		 705 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  43.41 
 
 		 705 aa  496  1e-139  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  42.65 
 
 		 705 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  42.2 
 
 		 696 aa  449  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  42.25 
 
 		 696 aa  448  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  33.62 
 
 		 698 aa  266  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.77 
 
 		 711 aa  263  6e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  32.87 
 
 		 712 aa  253  8.000000000000001e-66  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  33.66 
 
 		 710 aa  252  2e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  31.82 
 
 		 700 aa  248  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.03 
 
 		 711 aa  247  4e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  33.51 
 
 		 893 aa  245  1.9999999999999999e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  32.35 
 
 		 718 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  30.49 
 
 		 704 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.81 
 
 		 692 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  29.84 
 
 		 708 aa  240  5.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  28.77 
 
 		 708 aa  233  6e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  31.52 
 
 		 715 aa  233  6e-60  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  32.34 
 
 		 741 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  31.07 
 
 		 710 aa  231  3e-59  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  30.81 
 
 		 700 aa  229  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  31.55 
 
 		 715 aa  229  2e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.25 
 
 		 911 aa  227  4e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  29.69 
 
 		 893 aa  227  5.0000000000000005e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  27.3 
 
 		 702 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  29.96 
 
 		 729 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  30.75 
 
 		 699 aa  221  3e-56  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  26.82 
 
 		 703 aa  221  3.9999999999999997e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  26.19 
 
 		 702 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  30.29 
 
 		 697 aa  219  2e-55  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.5 
 
 		 702 aa  218  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  30.45 
 
 		 705 aa  215  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.93 
 
 		 711 aa  214  2.9999999999999995e-54  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  30.21 
 
 		 913 aa  214  4.9999999999999996e-54  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.01 
 
 		 918 aa  213  7.999999999999999e-54  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  29.4 
 
 		 892 aa  212  2e-53  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  30.2 
 
 		 718 aa  212  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  29.6 
 
 		 897 aa  211  3e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  30.74 
 
 		 893 aa  211  3e-53  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  29.99 
 
 		 920 aa  211  5e-53  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.27 
 
 		 706 aa  210  8e-53  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  29.09 
 
 		 708 aa  209  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  28.77 
 
 		 706 aa  207  4e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  29.45 
 
 		 697 aa  204  3e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  30.74 
 
 		 903 aa  204  3e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  26.22 
 
 		 698 aa  205  3e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  30.4 
 
 		 695 aa  204  6e-51  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.56 
 
 		 892 aa  202  9.999999999999999e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.88 
 
 		 697 aa  202  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.92 
 
 		 897 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.39 
 
 		 698 aa  201  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  29.83 
 
 		 715 aa  201  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  26.89 
 
 		 711 aa  200  9e-50  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  30.85 
 
 		 716 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.58 
 
 		 903 aa  199  1.0000000000000001e-49  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  30.54 
 
 		 695 aa  199  1.0000000000000001e-49  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  28.76 
 
 		 669 aa  197  4.0000000000000005e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  29.57 
 
 		 727 aa  197  6e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.86 
 
 		 714 aa  196  9e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  30.3 
 
 		 703 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  27.1 
 
 		 707 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.51 
 
 		 696 aa  193  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.49 
 
 		 929 aa  193  8e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  30.04 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  28.86 
 
 		 728 aa  192  2e-47  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  26.84 
 
 		 698 aa  191  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.64 
 
 		 696 aa  189  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  31.1 
 
 		 893 aa  189  1e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  29.71 
 
 		 690 aa  188  3e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  26.6 
 
 		 912 aa  188  3e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  26.58 
 
 		 697 aa  186  8e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  29.03 
 
 		 889 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  27.49 
 
 		 766 aa  186  2.0000000000000003e-45  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  27.74 
 
 		 905 aa  184  6e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  30.06 
 
 		 699 aa  182  1e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  28.88 
 
 		 709 aa  183  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  27.63 
 
 		 915 aa  182  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  26.79 
 
 		 704 aa  182  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.39 
 
 		 900 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  27.77 
 
 		 703 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  27.77 
 
 		 703 aa  179  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.42 
 
 		 911 aa  179  2e-43  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.87 
 
 		 895 aa  178  3e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  31.17 
 
 		 727 aa  178  3e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  30.85 
 
 		 904 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  28.53 
 
 		 715 aa  177  5e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  31.18 
 
 		 714 aa  176  9e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  27.54 
 
 		 660 aa  174  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 		 883 aa  172  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.04 
 
 		 660 aa  172  2e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1414  CoA-binding domain protein  26.17 
 
 		 695 aa  169  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  34.08 
 
 		 712 aa  168  2.9999999999999998e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  27.37 
 
 		 896 aa  167  5e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  27.4 
 
 		 700 aa  167  5.9999999999999996e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  29.43 
 
 		 705 aa  166  1.0000000000000001e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>