More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4495 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  54.34 
 
 
680 aa  677    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  53.76 
 
 
679 aa  668    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  87.43 
 
 
684 aa  1123    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  67.16 
 
 
687 aa  831    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  100 
 
 
684 aa  1367    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  43.2 
 
 
705 aa  518  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  43.92 
 
 
705 aa  504  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  43.63 
 
 
705 aa  490  1e-137  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  42.55 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  42.13 
 
 
696 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  30.03 
 
 
711 aa  257  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  31.57 
 
 
698 aa  256  1.0000000000000001e-66  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  32.26 
 
 
712 aa  253  1e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  31.76 
 
 
692 aa  249  1e-64  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.54 
 
 
711 aa  249  1e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  33.38 
 
 
710 aa  247  4.9999999999999997e-64  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  31.36 
 
 
700 aa  246  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.29 
 
 
708 aa  240  6.999999999999999e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.18 
 
 
893 aa  235  2.0000000000000002e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  30.89 
 
 
712 aa  232  2e-59  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  31.29 
 
 
697 aa  231  4e-59  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  30.42 
 
 
715 aa  231  5e-59  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  28.19 
 
 
702 aa  228  2e-58  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  30.74 
 
 
710 aa  228  3e-58  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  29.65 
 
 
704 aa  226  8e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  30.87 
 
 
702 aa  226  9e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
729 aa  226  9e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  30.01 
 
 
741 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  30.13 
 
 
700 aa  226  1e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  31.16 
 
 
715 aa  225  2e-57  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  29.49 
 
 
893 aa  224  6e-57  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  27.49 
 
 
702 aa  221  3e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1256  CoA-binding domain-containing protein  27.2 
 
 
703 aa  220  7e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.924242  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  30.18 
 
 
911 aa  219  2e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  29.61 
 
 
918 aa  218  2.9999999999999998e-55  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  30.03 
 
 
718 aa  216  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  30.22 
 
 
697 aa  214  3.9999999999999995e-54  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  26.87 
 
 
708 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  31.75 
 
 
703 aa  214  5.999999999999999e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  29.09 
 
 
705 aa  212  1e-53  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  28.99 
 
 
892 aa  212  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  29.42 
 
 
913 aa  211  3e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.21 
 
 
698 aa  211  3e-53  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  28.49 
 
 
698 aa  209  1e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4813  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  29.79 
 
 
883 aa  209  1e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104591  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  29.52 
 
 
715 aa  207  5e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  27.25 
 
 
706 aa  206  2e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.06 
 
 
892 aa  204  5e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  28.82 
 
 
766 aa  202  1.9999999999999998e-50  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30 
 
 
727 aa  202  1.9999999999999998e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  29.97 
 
 
695 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.97 
 
 
697 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  28.9 
 
 
728 aa  201  3e-50  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.34 
 
 
696 aa  201  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.93 
 
 
711 aa  200  7.999999999999999e-50  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  30.99 
 
 
897 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  30.07 
 
 
725 aa  199  2.0000000000000003e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.39 
 
 
714 aa  198  3e-49  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  28.35 
 
 
921 aa  198  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  29.57 
 
 
893 aa  197  4.0000000000000005e-49  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  28.73 
 
 
897 aa  196  8.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  28.35 
 
 
706 aa  196  1e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  27.07 
 
 
707 aa  195  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  27.76 
 
 
698 aa  194  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  30.76 
 
 
903 aa  194  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  29.55 
 
 
695 aa  194  6e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  28.45 
 
 
920 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  27.57 
 
 
669 aa  193  1e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  29.63 
 
 
716 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  26.3 
 
 
711 aa  191  2.9999999999999997e-47  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  28.85 
 
 
929 aa  188  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2866  CoA-binding domain protein  27.14 
 
 
697 aa  187  4e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  30.45 
 
 
690 aa  187  8e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.06 
 
 
915 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  27.29 
 
 
911 aa  180  7e-44  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  30.14 
 
 
699 aa  180  8e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  26.34 
 
 
905 aa  179  1e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1512  CoA-binding protein  28.71 
 
 
703 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1535  CoA-binding domain-containing protein  28.71 
 
 
703 aa  179  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  27.91 
 
 
889 aa  178  3e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  30.45 
 
 
702 aa  176  9.999999999999999e-43  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  26.47 
 
 
704 aa  176  1.9999999999999998e-42  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  29.02 
 
 
883 aa  175  2.9999999999999996e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5367  putative acyl-CoA synthetase  28.57 
 
 
715 aa  174  3.9999999999999995e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.147865  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  28.24 
 
 
900 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1903  putative acyl-CoA synthetase  28.03 
 
 
709 aa  174  6.999999999999999e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  26.45 
 
 
895 aa  172  1e-41  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  27.62 
 
 
660 aa  172  2e-41  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  30.33 
 
 
714 aa  171  3e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.76 
 
 
660 aa  171  5e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1377  CoA-binding domain-containing protein  30.2 
 
 
705 aa  171  5e-41  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.249497  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  31.18 
 
 
727 aa  170  9e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0317  CoA-binding domain protein  28.41 
 
 
704 aa  169  1e-40  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.11394 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1934  CoA-binding  25.11 
 
 
684 aa  169  1e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.569355  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  29.7 
 
 
904 aa  169  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  27.4 
 
 
700 aa  168  4e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0454  CoA-binding domain protein  29.05 
 
 
690 aa  163  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  27.46 
 
 
899 aa  162  2e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  25.32 
 
 
685 aa  160  5e-38  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  28.13 
 
 
902 aa  160  8e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>