More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2176 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012854  Rleg_6428  CoA-binding domain protein  66.72 
 
 		 684 aa  857    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.0804767 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3823  acyl-CoA synthetase, putative  55.51 
 
 		 680 aa  691    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2794  CoA-binding  54.17 
 
 		 679 aa  686    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.319847 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4495  CoA-binding domain protein  66.57 
 
 		 684 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2176  CoA-binding domain-containing protein  100 
 
 		 687 aa  1374    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3724  acyl-CoA synthetase, putative  39.63 
 
 		 705 aa  458  1e-127  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.79525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2182  acyl-CoA synthetase, putative  40.34 
 
 		 705 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.769961  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2039  CoA-binding domain-containing protein  40.2 
 
 		 705 aa  452  1e-125  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65810  hypothetical protein  40.6 
 
 		 696 aa  421  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.410069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5711  hypothetical protein  40.31 
 
 		 696 aa  416  9.999999999999999e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.717082  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3868  CoA-binding  31 
 
 		 711 aa  256  1.0000000000000001e-66  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.904082  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1809  CoA-binding domain-containing protein  32.31 
 
 		 710 aa  252  1e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5770  CoA-binding domain protein  31.52 
 
 		 704 aa  251  3e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.659357 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5203  CoA-binding  32.36 
 
 		 711 aa  251  4e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.136653  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6147  CoA-binding domain protein  32.78 
 
 		 698 aa  251  4e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.551757  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2598  CoA-binding  30.41 
 
 		 708 aa  250  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.321665 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3827  CoA-binding  32.91 
 
 		 700 aa  249  2e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1008  putative acyl-CoA synthetase  32.36 
 
 		 703 aa  246  9.999999999999999e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.218601  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4596  CoA-binding  32.07 
 
 		 712 aa  242  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1302  6-carboxyhexanoate--COA ligase  32.33 
 
 		 692 aa  241  2.9999999999999997e-62  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0303603  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3178  CoA-binding domain-containing protein  31.45 
 
 		 718 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1407  CoA-binding domain protein  30.81 
 
 		 699 aa  234  4.0000000000000004e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0674  CoA-binding protein  30 
 
 		 705 aa  234  5e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.673071  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5094  acyl-CoA synthetase domain-containing protein  31.29 
 
 		 718 aa  231  3e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.504195 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4367  pimeloyl-CoA synthetase  32.16 
 
 		 715 aa  230  5e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.589266  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  29.33 
 
 		 696 aa  229  1e-58  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0842  CoA-binding  30.24 
 
 		 700 aa  228  2e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.199193 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  31.56 
 
 		 893 aa  228  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  29.97 
 
 		 911 aa  228  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4411  CoA-binding domain-containing protein  30.68 
 
 		 712 aa  227  6e-58  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000943391  normal  0.877592 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5497  CoA-binding domain protein  31.87 
 
 		 710 aa  227  7e-58  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.05856  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4791  CoA-binding  31.17 
 
 		 741 aa  226  1e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.369027  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3883  CoA-binding  31.96 
 
 		 697 aa  224  3e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51170  pimeloyl-CoA synthetase  31 
 
 		 715 aa  223  6e-57  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000001397 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1759  CoA-binding domain-containing protein  31 
 
 		 700 aa  223  9.999999999999999e-57  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2759  CoA-binding domain-containing protein  29.78 
 
 		 729 aa  222  1.9999999999999999e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4084  CoA-binding domain protein  28.4 
 
 		 750 aa  220  6e-56  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.030706  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0568  putative CoA ligase  27.73 
 
 		 708 aa  218  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000830442  normal  0.832734 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2466  CoA-binding domain-containing protein  29.46 
 
 		 669 aa  218  2.9999999999999998e-55  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0380  CoA-binding  28.85 
 
 		 707 aa  217  5e-55  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1885  CoA-binding domain-containing protein  29.45 
 
 		 708 aa  214  3.9999999999999995e-54  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3325  CoA-binding domain protein  31.54 
 
 		 695 aa  214  3.9999999999999995e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0548156  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0206  CoA-binding domain-containing protein  27.09 
 
 		 698 aa  213  7.999999999999999e-54  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1420  CoA-binding domain-containing protein  26.21 
 
 		 702 aa  212  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.35616  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2035  CoA-binding domain protein  30.8 
 
 		 727 aa  211  4e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0700  CoA-binding domain-containing protein  26.07 
 
 		 702 aa  211  5e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3975  CoA-binding domain-containing protein  31.68 
 
 		 695 aa  209  1e-52  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.512176 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4556  CoA-binding  28.2 
 
 		 715 aa  209  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.732874  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2107  CoA-binding  29.94 
 
 		 702 aa  209  2e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0186682 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3312  CoA-binding  29.55 
 
 		 697 aa  208  3e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.292694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  28.22 
 
 		 918 aa  207  7e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1098  CoA-binding domain-containing protein  27.94 
 
 		 706 aa  206  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  28.49 
 
 		 892 aa  206  1e-51  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1266  CoA-binding domain-containing protein  26.24 
 
 		 706 aa  205  3e-51  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  29.27 
 
 		 892 aa  204  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0320  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.1 
 
 		 711 aa  203  7e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0034  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.36 
 
 		 714 aa  201  5e-50  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.530674  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  28.71 
 
 		 893 aa  201  6e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  27.8 
 
 		 929 aa  199  2.0000000000000003e-49  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4534  CoA-binding domain-containing protein  28.45 
 
 		 698 aa  197  4.0000000000000005e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1347  Acyl-CoA synthetase  26.55 
 
 		 696 aa  197  4.0000000000000005e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3750  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  26.3 
 
 		 697 aa  196  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  27.59 
 
 		 912 aa  195  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3063  CoA-binding domain-containing protein  25.96 
 
 		 711 aa  194  3e-48  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0980469  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3916  putative acetyl-CoA synthetase  30.44 
 
 		 703 aa  194  4e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.991862 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0076  acetyl coenzyme A synthetase subunit alpha  27.58 
 
 		 698 aa  194  4e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000310794 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1473  putative pimeloyl-CoA synthetase  31.54 
 
 		 716 aa  192  1e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.21292  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  30.15 
 
 		 893 aa  192  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0645  CoA-binding domain protein  27.85 
 
 		 728 aa  188  3e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  29.38 
 
 		 893 aa  187  4e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2602  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  25.96 
 
 		 660 aa  186  2.0000000000000003e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.470486  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  28.21 
 
 		 911 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3421  CoA-binding domain protein  30.16 
 
 		 690 aa  185  2.0000000000000003e-45  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.678339  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  28.85 
 
 		 903 aa  184  7e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1399  CoA-binding domain-containing protein  27.25 
 
 		 660 aa  183  7e-45  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.578078  hitchhiker  0.000299945 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  26.15 
 
 		 915 aa  183  1e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1966  CoA-binding domain-containing protein  24.76 
 
 		 712 aa  182  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3702  CoA-binding  29.27 
 
 		 725 aa  182  2e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0602  CoA-binding domain-containing protein  26.45 
 
 		 704 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  28.49 
 
 		 889 aa  181  4e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  27.15 
 
 		 897 aa  181  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  27.26 
 
 		 913 aa  180  5.999999999999999e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  27.29 
 
 		 920 aa  179  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  26.85 
 
 		 904 aa  179  2e-43  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  26.38 
 
 		 921 aa  178  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0895  ATP-grasp domain-containing protein  27.44 
 
 		 700 aa  178  3e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3774  CoA-binding domain protein  30.83 
 
 		 714 aa  177  4e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2081  CoA-binding domain-containing protein  27.02 
 
 		 701 aa  177  4e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3321  CoA-binding domain-containing protein  28.69 
 
 		 703 aa  174  5e-42  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.776977  normal  0.186489 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1097  CoA-binding domain-containing protein  29.27 
 
 		 702 aa  173  6.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1304  CoA-binding domain protein  30.78 
 
 		 904 aa  173  9e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.969979 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1907  CoA-binding  31.66 
 
 		 699 aa  173  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.805485  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_5066  CoA-binding domain-containing protein  31.21 
 
 		 727 aa  172  2e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.243634 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  29.56 
 
 		 897 aa  172  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1004  GCN5-related N-acetyltransferase  27.61 
 
 		 883 aa  171  5e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  25.91 
 
 		 895 aa  170  1e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2453  GCN5-related N-acetyltransferase  29.52 
 
 		 926 aa  167  4e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00000141408  hitchhiker  0.0047804 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3448  CoA-binding domain-containing protein  29.84 
 
 		 898 aa  167  5.9999999999999996e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401225  normal  0.714388 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2291  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  26.27 
 
 		 699 aa  167  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.494487  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG1328  CoA ligase family protein  25.94 
 
 		 685 aa  164  7e-39  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>