More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2352 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002977  MCA2420  acetyltransferase  43.89 
 
 
892 aa  733    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.773408  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  45.76 
 
 
905 aa  806    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0056  GCN5-related N-acetyltransferase  77.34 
 
 
896 aa  1425    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.145927 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4246  GCN5-related N-acetyltransferase  68.5 
 
 
904 aa  1244    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3063  acetyltransferase  46.92 
 
 
897 aa  763    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0540  GCN5-related N-acetyltransferase  61.83 
 
 
895 aa  1156    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2024  long-chain fatty-acid-CoA ligase  47.51 
 
 
892 aa  805    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1676  GCN5-related N-acetyltransferase  47.67 
 
 
889 aa  810    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1862  CoA-binding domain protein  42.76 
 
 
900 aa  683    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.167225  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2819  GCN5-related N-acetyltransferase  73.33 
 
 
897 aa  1345    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.869939 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2352  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
892 aa  1803    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2041  CoA-binding domain protein  44.67 
 
 
895 aa  780    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.171993  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1513  putative acetyl-CoA synthetase  68.61 
 
 
892 aa  1288    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.417267  normal  0.191357 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1832  GCN5-related N-acetyltransferase  71.89 
 
 
901 aa  1330    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.52555  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1011  acyl-CoA synthetase (ADP forming)  74.89 
 
 
918 aa  1366    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.415353  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2023  GCN5-related N-acetyltransferase  71.89 
 
 
908 aa  1330    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0872701  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1092  GCN5-related N-acetyltransferase  39.62 
 
 
893 aa  578  1.0000000000000001e-163  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.20314  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1501  CoA-binding domain protein  39.6 
 
 
886 aa  575  1.0000000000000001e-163  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.137638  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1969  CoA-binding domain-containing protein  40.19 
 
 
893 aa  570  1e-161  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0683536  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  36.67 
 
 
915 aa  562  1e-158  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1742  GCN5-related N-acetyltransferase  38.82 
 
 
903 aa  555  1e-157  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1784  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  38.27 
 
 
929 aa  554  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1205  CoA-binding  39.6 
 
 
903 aa  552  1e-155  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.370285  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1804  N-acetyltransferase  36.72 
 
 
913 aa  548  1e-154  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2131  CoA-binding domain protein  37.95 
 
 
904 aa  547  1e-154  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.131154  normal  0.594511 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2065  hypothetical protein  39.06 
 
 
897 aa  543  1e-153  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4272  CoA-binding domain protein  35.53 
 
 
921 aa  544  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0007  GCN5-related N-acetyltransferase  39.69 
 
 
890 aa  541  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5003  CoA-binding domain protein  35.97 
 
 
920 aa  538  1e-151  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4045  GCN5-related N-acetyltransferase  36.63 
 
 
899 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.565149  normal  0.994893 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2544  CoA-binding protein  37.13 
 
 
911 aa  539  1e-151  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.163603  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3006  CoA-binding protein  35.89 
 
 
912 aa  535  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000257819 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4664  GCN5-related N-acetyltransferase  36.53 
 
 
918 aa  525  1e-147  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3208  acetyltransferase  37.15 
 
 
911 aa  523  1e-147  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4719  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
907 aa  522  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.345229  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1776  GCN5-related N-acetyltransferase  36.05 
 
 
898 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.634734 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0400  GCN5-related N-acetyltransferase  37.05 
 
 
898 aa  514  1e-144  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.249053  normal  0.200769 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5753  hypothetical protein  36.56 
 
 
897 aa  509  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1351  GCN5-related N-acetyltransferase  36.98 
 
 
907 aa  507  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1919  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
897 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2530  GCN5-related N-acetyltransferase  34.37 
 
 
896 aa  497  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2078  GCN5-related N-acetyltransferase  34.63 
 
 
896 aa  494  9.999999999999999e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0450979  normal  0.503964 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2324  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
898 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  36.18 
 
 
893 aa  490  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1371  GCN5-related N-acetyltransferase  36.55 
 
 
907 aa  488  1e-136  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.870954  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1760  acetyltransferase  34.45 
 
 
911 aa  488  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0308068 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2228  GCN5-related N-acetyltransferase  37.65 
 
 
893 aa  483  1e-135  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  unclonable  0.00661786  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1084  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2761  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  34.53 
 
 
886 aa  481  1e-134  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.282153  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3821  acetyltransferase, GNAT family protein  34.35 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.126569  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2741  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  34.46 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.225885  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2871  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  34.46 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.288181  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2952  acetyltransferase, GNAT family protein  34.57 
 
 
886 aa  482  1e-134  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487518  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2737  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  34.57 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.028573  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1093  GCN5-related N-acetyltransferase  34.46 
 
 
886 aa  481  1e-134  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.312736  normal  0.038329 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02478  fused predicted acyl-CoA synthetase: NAD(P)-binding subunit/ATP-binding subunit  34.23 
 
 
886 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2845  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  34.42 
 
 
886 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02442  hypothetical protein  34.23 
 
 
886 aa  478  1e-133  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2867  CoA binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  34.42 
 
 
886 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2863  CoA binding domain/acetyltransferase domain protein  34.42 
 
 
886 aa  479  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2979  CoA-binding domain/acetyltransferase domain-containing protein  34.42 
 
 
886 aa  478  1e-133  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3069  GCN5-related N-acetyltransferase  35.67 
 
 
887 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.835722  hitchhiker  0.00746938 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1928  CoA-binding domain-containing protein  33 
 
 
900 aa  476  1e-133  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.517585  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1877  GCN5-related N-acetyltransferase  33.96 
 
 
899 aa  474  1e-132  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2039  GCN5-related N-acetyltransferase  33.48 
 
 
900 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.583899  normal  0.0195221 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7760  putative Acetyl-CoA synthetase  35.07 
 
 
903 aa  467  9.999999999999999e-131  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0734608  normal  0.0277308 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2458  CoA-binding domain-containing protein  34.25 
 
 
893 aa  467  9.999999999999999e-131  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.366091  normal  0.773834 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0885  GCN5-related N-acetyltransferase  35.02 
 
 
887 aa  462  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2252  CoA-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
901 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0699279  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1876  CoA-binding domain-containing protein  33.33 
 
 
913 aa  464  1e-129  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.766873 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1477  GCN5-related N-acetyltransferase  34.05 
 
 
896 aa  463  1e-129  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.630899  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02893  acetyltransferase, gnat family  34.62 
 
 
902 aa  465  1e-129  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2093  CoA-binding domain protein  33.18 
 
 
901 aa  463  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.642552  normal  0.884051 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2369  CoA-binding domain-containing protein  33.18 
 
 
901 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.181802  normal  0.823699 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2105  CoA-binding domain-containing protein  33.07 
 
 
905 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.965972  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3337  GCN5-related N-acetyltransferase  35.32 
 
 
882 aa  461  9.999999999999999e-129  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0852  GCN5-related N-acetyltransferase  34.79 
 
 
888 aa  461  9.999999999999999e-129  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.121285  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2223  CoA-binding domain-containing protein  33.37 
 
 
904 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.652784 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  35.22 
 
 
880 aa  459  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  35.22 
 
 
880 aa  459  1e-127  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1718  CoA-binding domain protein  36.3 
 
 
901 aa  457  1e-127  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3493  GCN5-related N-acetyltransferase  35.13 
 
 
882 aa  456  1e-127  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  35.22 
 
 
880 aa  459  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2098  CoA-binding domain-containing protein  33.11 
 
 
913 aa  459  1e-127  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.865996 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1837  CoA-binding domain-containing protein  33.22 
 
 
899 aa  456  1e-127  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.515671  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3748  GCN5-related N-acetyltransferase  34.55 
 
 
882 aa  456  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0223555  normal  0.236384 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2116  acetyltransferase  32.89 
 
 
903 aa  453  1.0000000000000001e-126  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5313  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
900 aa  454  1.0000000000000001e-126  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.653204  normal  0.891732 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3902  GCN5-related N-acetyltransferase  34.5 
 
 
906 aa  451  1e-125  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.835064  normal  0.701113 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4771  GCN5-related N-acetyltransferase  36.85 
 
 
900 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5238  GCN5-related N-acetyltransferase  36.85 
 
 
900 aa  448  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.365104 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2589  CoA-binding domain-containing protein  34.95 
 
 
918 aa  444  1e-123  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.121473 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2345  GCN5-related N-acetyltransferase  34.27 
 
 
897 aa  444  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0272311 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0641  putative acetyltransferase  33.54 
 
 
894 aa  440  9.999999999999999e-123  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0517874  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000156  protein acetyltransferase  33.73 
 
 
877 aa  429  1e-119  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.775567  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  33.86 
 
 
877 aa  432  1e-119  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4638  CoA-binding domain protein  34.57 
 
 
907 aa  427  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.349562  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1037  GCN5-related N-acetyltransferase  34.73 
 
 
887 aa  428  1e-118  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.737751  normal  0.467815 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2502  GCN5-related N-acetyltransferase  31.99 
 
 
915 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3834  acetyl coenzyme A synthetase (ADP forming), alpha domain protein  36.43 
 
 
696 aa  422  1e-116  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000102381 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>