134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5341 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  350  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  98.22 
 
 
169 aa  342  2e-93  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  89.94 
 
 
169 aa  324  4.0000000000000003e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  90.53 
 
 
169 aa  323  8.000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  92.22 
 
 
167 aa  320  6e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  90.53 
 
 
193 aa  305  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  77.38 
 
 
191 aa  281  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  78.44 
 
 
191 aa  276  8e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  73.81 
 
 
189 aa  263  7e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  72.62 
 
 
189 aa  262  2e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  74.69 
 
 
183 aa  255  2e-67  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  73.21 
 
 
189 aa  243  9.999999999999999e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  66.46 
 
 
162 aa  221  3e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  56.88 
 
 
173 aa  182  2.0000000000000003e-45  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  55 
 
 
160 aa  170  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  48.45 
 
 
171 aa  168  3e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  53.12 
 
 
160 aa  166  1e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  51.95 
 
 
160 aa  157  8e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  46.06 
 
 
174 aa  153  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  47.5 
 
 
160 aa  152  2e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  56.12 
 
 
162 aa  150  7e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  54.48 
 
 
139 aa  149  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
173 aa  146  1.0000000000000001e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  44.1 
 
 
178 aa  139  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.34 
 
 
164 aa  137  6e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  47.5 
 
 
163 aa  137  1e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  46.88 
 
 
163 aa  134  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  44.29 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  40.51 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  45.62 
 
 
185 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  40.51 
 
 
165 aa  129  3e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  46.25 
 
 
162 aa  127  6e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
165 aa  124  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
161 aa  120  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  40.62 
 
 
159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  38.61 
 
 
162 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  39.13 
 
 
177 aa  112  2.0000000000000002e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  37.13 
 
 
174 aa  104  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  31.17 
 
 
161 aa  95.5  3e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 
168 aa  94.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  36.55 
 
 
160 aa  92  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  39.81 
 
 
182 aa  91.7  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  31.79 
 
 
203 aa  89.7  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  36.49 
 
 
338 aa  87  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  34.25 
 
 
195 aa  85.5  3e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  33.1 
 
 
163 aa  84.7  6e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  27.95 
 
 
166 aa  79  0.00000000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  36.13 
 
 
533 aa  78.2  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  30.08 
 
 
173 aa  75.1  0.0000000000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  28.89 
 
 
240 aa  68.9  0.00000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  30.61 
 
 
310 aa  60.1  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 
220 aa  56.6  0.0000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  35.96 
 
 
166 aa  53.5  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  34.41 
 
 
162 aa  52.4  0.000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
161 aa  51.6  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  26.59 
 
 
165 aa  49.3  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0856  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
352 aa  48.9  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  38.27 
 
 
181 aa  49.3  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  31.19 
 
 
217 aa  48.5  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2145  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.299781  hitchhiker  0.00179484 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2515  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
158 aa  48.9  0.00004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0401  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.27 
 
 
163 aa  48.1  0.00005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0319315 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.26 
 
 
156 aa  48.1  0.00006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  33.58 
 
 
153 aa  47.8  0.00007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
179 aa  47.8  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  23.26 
 
 
181 aa  47.8  0.00008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05103  acetyltransferase  27.86 
 
 
166 aa  47.4  0.00009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.06 
 
 
167 aa  47  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0638  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  31.72 
 
 
154 aa  47.4  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3663  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.65018 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  36.59 
 
 
181 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0487  N-acetyltransferase  30.66 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  30.28 
 
 
312 aa  46.2  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
181 aa  46.2  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  32.54 
 
 
182 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4740  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
171 aa  46.6  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.613369 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3727  GCN5-related N-acetyltransferase  33.93 
 
 
167 aa  45.8  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1378  GCN5-related N-acetyltransferase  32.63 
 
 
137 aa  45.8  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  29.65 
 
 
179 aa  45.8  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.74 
 
 
153 aa  45.4  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0847  GCN5-related N-acetyltransferase  26.81 
 
 
165 aa  45.4  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4072  GCN5-related N-acetyltransferase  27.39 
 
 
159 aa  45.1  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.232011 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2997  GCN5-related N-acetyltransferase  27.12 
 
 
166 aa  44.3  0.0007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  28.81 
 
 
185 aa  44.3  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
172 aa  44.3  0.0008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  27.14 
 
 
165 aa  43.5  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.53 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2237  CoA-binding domain protein  26.76 
 
 
950 aa  44.3  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0315579  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4716  GCN5-related N-acetyltransferase  31.09 
 
 
164 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.105051 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  30.19 
 
 
158 aa  43.9  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  34.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.84 
 
 
176 aa  43.5  0.002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4827  acetyltransferase  33.96 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1381  GCN5-related N-acetyltransferase  30.16 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1469  CoA-binding domain protein  29.58 
 
 
902 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_37660  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  30.17 
 
 
306 aa  42.7  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  32.58 
 
 
167 aa  43.1  0.002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4512  acetyltransferase  33.02 
 
 
167 aa  42.4  0.003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0128967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>