94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2421 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  100 
 
 
183 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  97.81 
 
 
189 aa  370  1e-102  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  93.44 
 
 
189 aa  357  4e-98  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  97.81 
 
 
189 aa  355  2.9999999999999997e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  79.78 
 
 
191 aa  307  5.9999999999999995e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  79.78 
 
 
191 aa  303  8.000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  74.69 
 
 
169 aa  257  5.0000000000000005e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  75.31 
 
 
169 aa  256  1e-67  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  76.58 
 
 
167 aa  256  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  74.69 
 
 
169 aa  255  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  73.46 
 
 
169 aa  253  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  73.46 
 
 
193 aa  236  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  60.26 
 
 
162 aa  205  4e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  57.86 
 
 
173 aa  191  7e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  47.74 
 
 
171 aa  158  3e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  49.35 
 
 
160 aa  155  4e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  45.22 
 
 
174 aa  150  1e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  51.32 
 
 
160 aa  148  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  50.66 
 
 
160 aa  146  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  45.7 
 
 
160 aa  146  2.0000000000000003e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  52.52 
 
 
162 aa  145  3e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  50.75 
 
 
139 aa  143  1e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  45.91 
 
 
164 aa  142  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  47.65 
 
 
163 aa  137  7e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  46.98 
 
 
163 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  44.29 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  45.03 
 
 
185 aa  129  3e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  40.13 
 
 
161 aa  128  6e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  39.61 
 
 
165 aa  127  1.0000000000000001e-28  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  126  2.0000000000000002e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  39.61 
 
 
165 aa  126  2.0000000000000002e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  38.71 
 
 
178 aa  120  8e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  44.37 
 
 
162 aa  119  3e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  40.79 
 
 
162 aa  117  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  38.71 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  39.1 
 
 
165 aa  116  1.9999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.93 
 
 
174 aa  104  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  34.81 
 
 
161 aa  96.3  2e-19  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  38.4 
 
 
338 aa  93.6  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.67 
 
 
168 aa  92.4  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  31.45 
 
 
182 aa  91.7  6e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  34.86 
 
 
195 aa  89.4  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  33.33 
 
 
160 aa  85.9  3e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  32.11 
 
 
203 aa  84.7  6e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
173 aa  79.3  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  36.45 
 
 
166 aa  75.1  0.0000000000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  28.78 
 
 
163 aa  72.8  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  40 
 
 
533 aa  66.6  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  28.99 
 
 
240 aa  65.1  0.0000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  37.61 
 
 
162 aa  64.7  0.0000000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  25.93 
 
 
310 aa  60.5  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  28.83 
 
 
166 aa  59.3  0.00000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  29.17 
 
 
217 aa  58.9  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  32.2 
 
 
220 aa  58.5  0.00000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 
181 aa  57.8  0.00000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0359  GCN5-related N-acetyltransferase  37.8 
 
 
179 aa  51.2  0.000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  32.77 
 
 
173 aa  50.1  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.45 
 
 
156 aa  48.9  0.00004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  29.36 
 
 
165 aa  48.1  0.00007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  31.16 
 
 
181 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.603997 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0341  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
179 aa  47.4  0.0001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  30.36 
 
 
172 aa  47.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0531  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.36 
 
 
165 aa  46.2  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.351155  normal  0.378658 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4438  GCN5-related N-acetyltransferase  32.67 
 
 
153 aa  45.8  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
161 aa  46.2  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  30.43 
 
 
167 aa  46.2  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0259  GCN5-related N-acetyltransferase  27.87 
 
 
143 aa  45.8  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4493  transcriptional regulator, ArsR family  33 
 
 
302 aa  45.4  0.0005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.234316  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2775  putative acetyltransferase  35.23 
 
 
312 aa  45.1  0.0006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.22239  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  29.31 
 
 
178 aa  43.9  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2122  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.76 
 
 
153 aa  43.9  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  29.46 
 
 
172 aa  43.5  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0021  GCN5-related N-acetyltransferase  30.94 
 
 
181 aa  43.1  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1585  GCN5-related N-acetyltransferase  31.86 
 
 
161 aa  43.5  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0457  GCN5-related N-acetyltransferase  30.47 
 
 
310 aa  43.1  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.414907 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2629  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
167 aa  43.5  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1982  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  39.77 
 
 
153 aa  43.5  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.615427 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  30.28 
 
 
176 aa  42.4  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4654  GCN5-related N-acetyltransferase  28.91 
 
 
172 aa  42.7  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.847229 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06373  hypothetical protein  28.3 
 
 
184 aa  42.4  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1276  phosphinothricin acetyltransferase, putative  30.43 
 
 
170 aa  42.4  0.004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2667  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
178 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.065079  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  32.39 
 
 
177 aa  42  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2454  acetyltransferase, GNAT family  24.38 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2637  acetyltransferase  23.87 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.439574  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2828  acetyltransferase  23.87 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.738685  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2834  acetyltransferase, GNAT family  23.87 
 
 
167 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000815753 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2877  acetyltransferase, GNAT family  24.38 
 
 
167 aa  41.2  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0106791  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  34.07 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2277  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.56 
 
 
167 aa  41.2  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2612  acetyltransferase, GNAT family  31.48 
 
 
167 aa  40.8  0.01  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.000687375  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>