150 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_13010 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  100 
 
 
177 aa  355  1.9999999999999998e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  57.99 
 
 
174 aa  182  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  52.76 
 
 
178 aa  166  1e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  52.17 
 
 
165 aa  165  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  55.35 
 
 
164 aa  162  3e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  54.6 
 
 
162 aa  161  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  49.38 
 
 
174 aa  160  1e-38  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  48.47 
 
 
160 aa  158  4e-38  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  52.76 
 
 
173 aa  151  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  47.24 
 
 
160 aa  147  5e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
160 aa  145  2.0000000000000003e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  47.2 
 
 
161 aa  145  4.0000000000000006e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
160 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 
171 aa  135  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  44.65 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  44.65 
 
 
165 aa  134  6.0000000000000005e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  44.03 
 
 
165 aa  133  9.999999999999999e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  52.08 
 
 
162 aa  133  9.999999999999999e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  44.79 
 
 
163 aa  125  4.0000000000000003e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 
169 aa  124  8.000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
163 aa  123  1e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  42.77 
 
 
159 aa  122  3e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
165 aa  122  3e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  41.21 
 
 
173 aa  121  4e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
169 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
191 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  40.25 
 
 
189 aa  118  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  38.71 
 
 
183 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  42.22 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  37.74 
 
 
189 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  44.6 
 
 
139 aa  116  1.9999999999999998e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
169 aa  115  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  37.89 
 
 
191 aa  115  3e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  39.13 
 
 
169 aa  112  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  41.96 
 
 
338 aa  110  7.000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  36.65 
 
 
162 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
167 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  37.89 
 
 
189 aa  108  5e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  40.37 
 
 
193 aa  106  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  35.23 
 
 
203 aa  102  4e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  32.7 
 
 
182 aa  93.6  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  32.3 
 
 
168 aa  92  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  35.76 
 
 
160 aa  91.7  5e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  26.45 
 
 
166 aa  81.6  0.000000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  25.68 
 
 
161 aa  80.9  0.000000000000009  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  33.68 
 
 
173 aa  77  0.0000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  35.4 
 
 
533 aa  74.7  0.0000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
163 aa  74.3  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  29.69 
 
 
310 aa  66.6  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  34.31 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  27.39 
 
 
220 aa  59.3  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0193  putative acetyltransferase  31.21 
 
 
153 aa  53.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  31.61 
 
 
164 aa  51.2  0.000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2839  GCN5-related N-acetyltransferase  32.74 
 
 
178 aa  50.4  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0772074  normal  0.0165254 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0154  GCN5-related N-acetyltransferase  33.62 
 
 
150 aa  50.8  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.48741  hitchhiker  0.00206835 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20380  acetyltransferase  41.77 
 
 
184 aa  50.4  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4542  GCN5-related N-acetyltransferase  32.33 
 
 
149 aa  49.7  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.3744 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  32.17 
 
 
186 aa  49.7  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2578  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.186902  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
171 aa  48.9  0.00003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
185 aa  49.3  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4021  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
166 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.193056  normal  0.623875 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  40.66 
 
 
193 aa  48.5  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  32.94 
 
 
217 aa  48.5  0.00005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  32.47 
 
 
171 aa  47.8  0.00008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7075  GCN5-related N-acetyltransferase  28.35 
 
 
153 aa  47.4  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  32.56 
 
 
162 aa  47.4  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1487  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
150 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000137269 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  31.65 
 
 
181 aa  47  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0659  GCN5-related N-acetyltransferase  34.44 
 
 
172 aa  46.6  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2718  GCN5-related N-acetyltransferase:CoA-binding  38.2 
 
 
905 aa  46.6  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.0140591 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3388  GCN5-related N-acetyltransferase  30.7 
 
 
156 aa  46.6  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.98 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  31.76 
 
 
209 aa  46.6  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4793  GCN5-related N-acetyltransferase  34.04 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.784559  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  33.56 
 
 
180 aa  46.6  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  34.78 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1865  GCN5-related N-acetyltransferase  30.22 
 
 
175 aa  45.8  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.00546663  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3680  GCN5-related N-acetyltransferase  30.87 
 
 
162 aa  46.2  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.570513  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4262  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.76 
 
 
162 aa  45.8  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1544  GCN5-related N-acetyltransferase  32.41 
 
 
163 aa  45.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.405729 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  34.78 
 
 
193 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3765  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
166 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.519007  normal  0.308179 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  34.78 
 
 
172 aa  45.8  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  37.37 
 
 
185 aa  45.8  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589494  normal  0.952102 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0859  putative acetyltransferase  48.28 
 
 
177 aa  45.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0426364 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4060  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
166 aa  45.4  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0878  GCN5-related N-acetyltransferase  32.95 
 
 
149 aa  45.1  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  37.23 
 
 
166 aa  45.4  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3266  GCN5-related N-acetyltransferase  31.33 
 
 
158 aa  45.1  0.0005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5125  GCN5-related N-acetyltransferase  30.67 
 
 
158 aa  45.1  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.281368 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6761  GCN5-related N-acetyltransferase  25 
 
 
161 aa  44.7  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4546  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
179 aa  44.7  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.132428  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1718  acetyltransferase, GNAT family  33.91 
 
 
193 aa  44.7  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01405  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  33.91 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3472  MarR family transcriptional regulator  34.15 
 
 
326 aa  44.7  0.0008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01416  hypothetical protein  33.91 
 
 
172 aa  44.7  0.0008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  36.04 
 
 
179 aa  44.3  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>