117 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_2307 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_2307  putative acetyltransferase  100 
 
 
139 aa  288  2e-77  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.646329  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5882  GCN5-related N-acetyltransferase  61.87 
 
 
160 aa  182  1.0000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0047  GCN5-related N-acetyltransferase  57.97 
 
 
165 aa  181  4.0000000000000006e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.66941  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5025  GCN5-related N-acetyltransferase  62.59 
 
 
162 aa  179  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6796  GCN5-related N-acetyltransferase  61.87 
 
 
160 aa  179  8.000000000000001e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0303  GCN5-related N-acetyltransferase  57.55 
 
 
160 aa  172  9e-43  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0653192 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0524  GCN5-related N-acetyltransferase  60.43 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.610284  normal  0.0661869 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5091  GCN5-related N-acetyltransferase  55.22 
 
 
167 aa  152  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.839368 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0231  putative acetyltransferase  47.86 
 
 
174 aa  150  4e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.329835 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0410  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
171 aa  149  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.539427  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3509  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
169 aa  149  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.475191  normal  0.0883622 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2343  GCN5-related N-acetyltransferase  52.24 
 
 
191 aa  149  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.632249  normal  0.0872678 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5341  GCN5-related N-acetyltransferase  54.48 
 
 
169 aa  149  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4459  GCN5-related N-acetyltransferase  53.73 
 
 
162 aa  148  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3917  GCN5-related N-acetyltransferase  52.99 
 
 
169 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.93894 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2511  GCN5-related N-acetyltransferase  53.73 
 
 
169 aa  145  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.232061  normal  0.976863 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4429  GCN5-related N-acetyltransferase  53.24 
 
 
185 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.644059 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2421  acetyltransferase  50.75 
 
 
183 aa  143  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.966349  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3954  GCN5-related N-acetyltransferase  52.52 
 
 
163 aa  143  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2533  acetyltransferase, GNAT family  50.75 
 
 
191 aa  143  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.177465  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4322  GCN5-related N-acetyltransferase  52.52 
 
 
163 aa  143  1e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.21987 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0018  GCN5-related N-acetyltransferase  50.75 
 
 
173 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2061  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 
189 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0996042  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  50.75 
 
 
189 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3603  GCN5-related N-acetyltransferase  52.99 
 
 
193 aa  135  2e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0104  GCN5-related N-acetyltransferase  53.62 
 
 
162 aa  134  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3274  GCN5-related N-acetyltransferase  50.75 
 
 
189 aa  131  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2527  GCN5-related N-acetyltransferase  49.25 
 
 
173 aa  131  3.9999999999999996e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1769  acetyltransferase  47.48 
 
 
165 aa  130  6e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000686927  normal  0.0139792 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1604  GCN5-related N-acetyltransferase  47.48 
 
 
165 aa  130  6e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.386581  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3478  GCN5-related N-acetyltransferase  51.11 
 
 
164 aa  129  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1499  acetyltransferase  46.76 
 
 
165 aa  129  2.0000000000000002e-29  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  5.02186e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2899  GCN5-related N-acetyltransferase  45.71 
 
 
178 aa  124  4.0000000000000003e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1269  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  47.14 
 
 
338 aa  119  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955314 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13010  sortase-like acyltransferase  44.6 
 
 
177 aa  116  9.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1964  GCN5-related N-acetyltransferase  53.21 
 
 
159 aa  111  3e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0200321 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3278  GCN5-related N-acetyltransferase  37.93 
 
 
182 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.645452 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4611  GCN5-related N-acetyltransferase  42.11 
 
 
162 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7386  GCN5-related N-acetyltransferase  43.17 
 
 
165 aa  107  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0047  GCN5-related protein N-acetyltransferase  44.36 
 
 
174 aa  105  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5083  GCN5-related N-acetyltransferase  37.41 
 
 
161 aa  95.9  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000356618 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6889  hypothetical protein  37.89 
 
 
195 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0403  GCN5-related N-acetyltransferase  40.59 
 
 
161 aa  91.3  4e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1711  GCN5-related N-acetyltransferase  39.45 
 
 
163 aa  87.8  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000345793  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1377  GCN5-related N-acetyltransferase  39.25 
 
 
168 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000000971374  normal  0.678083 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10460  sortase-like acyltransferase  40.59 
 
 
160 aa  82.8  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.81082  hitchhiker  0.0000000159699 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0542  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
173 aa  80.9  0.000000000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.2131e-24  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3341  GCN5-related N-acetyltransferase  32.82 
 
 
166 aa  79  0.00000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0179  putative acetyltransferase  32.57 
 
 
203 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.410647 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_47700  predicted protein  30.37 
 
 
240 aa  75.9  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.106047  normal  0.135513 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03879  histone acetylase (Eurofung)  31.21 
 
 
533 aa  74.7  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0406003  normal 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_62621  predicted protein  28.67 
 
 
310 aa  67.8  0.00000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.15027  normal  0.247728 
 
 
-
 
NC_006670  CNA02770  conserved hypothetical protein  34.29 
 
 
220 aa  66.6  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02102  acetyltransferase, GNAT family, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G05085)  31.07 
 
 
217 aa  55.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413597  normal  0.539659 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07810  acetyltransferase (GNAT) family protein  38 
 
 
328 aa  54.7  0.0000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0083  acetyltransferase  32.04 
 
 
162 aa  52.4  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0818  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  32.71 
 
 
156 aa  52.4  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1781  GCN5-related N-acetyltransferase  28.7 
 
 
169 aa  52.8  0.000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0840  hypothetical protein  30 
 
 
161 aa  49.7  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000581009  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1180  acetyltransferase (GNAT) family protein  28.32 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  39.73 
 
 
161 aa  46.2  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0215  GCN5-related N-acetyltransferase  25.69 
 
 
181 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2153  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
176 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0187  GCN5-related N-acetyltransferase  26.36 
 
 
166 aa  46.2  0.0002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  4.46628e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1601  GCN5-related N-acetyltransferase  25.18 
 
 
165 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1977  acetyltransferase  31.3 
 
 
163 aa  44.7  0.0004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2884  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 
335 aa  44.7  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00177326  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1068  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.52 
 
 
176 aa  45.1  0.0004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003230  acetyltransferase  31.87 
 
 
166 aa  44.7  0.0004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0903  GCN5-related N-acetyltransferase  29.92 
 
 
173 aa  44.3  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.707414 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0025  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.18 
 
 
176 aa  44.7  0.0005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0146128 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4258  GCN5-related N-acetyltransferase  28.79 
 
 
172 aa  44.3  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0726  GCN5-related N-acetyltransferase  29.29 
 
 
262 aa  44.3  0.0006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.604873  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0587  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.36 
 
 
161 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2553  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.06 
 
 
154 aa  44.3  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.394182 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0455  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  36.84 
 
 
161 aa  43.9  0.0008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0029  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30 
 
 
176 aa  42.7  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06700  acetyltransferase  42.86 
 
 
171 aa  43.5  0.001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0881  GCN5-related N-acetyltransferase  31.48 
 
 
178 aa  43.5  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.294574  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4523  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
172 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.31037  normal  0.0470006 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 
180 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2210  GCN5-related N-acetyltransferase  31.36 
 
 
178 aa  42.7  0.002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.236842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0451  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  37.21 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.237261  normal  0.21321 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  30.61 
 
 
154 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5404  GCN5-related N-acetyltransferase  28.83 
 
 
166 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0298216  normal  0.693163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0310  acetyltransferase  24.37 
 
 
168 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.944664  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0644  GCN5-related N-acetyltransferase  27.38 
 
 
195 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  29.73 
 
 
179 aa  42  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2109  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 
314 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.67396  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  29.59 
 
 
154 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4857  GCN5-related N-acetyltransferase  27.93 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0043  putative ribosomal-protein-alanine acetyltransferase, RimI-like protein  35.62 
 
 
160 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.583173  normal  0.569351 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4646  GCN5-related N-acetyltransferase  30.17 
 
 
166 aa  41.6  0.004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.128668  normal  0.0465376 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3222  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
168 aa  41.6  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.510558  normal  0.172445 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0348  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.5 
 
 
144 aa  41.2  0.005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4642  GCN5-related N-acetyltransferase  34.58 
 
 
185 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.589494  normal  0.952102 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1494  putative acetyltransferase  29.07 
 
 
167 aa  41.2  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.190501  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  29.75 
 
 
184 aa  41.2  0.005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4525  MarR family transcriptional regulator  34.41 
 
 
315 aa  40.8  0.006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
175 aa  40.8  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>