More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_0528 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
181 aa  368  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  88 
 
 
205 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  76.57 
 
 
176 aa  286  1e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0238  GCN5-related N-acetyltransferase  74.71 
 
 
183 aa  268  2e-71  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0385  phosphinothricin acetyltransferase (PPT N-acetyltransferase)  73.56 
 
 
176 aa  263  1e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  70.69 
 
 
174 aa  255  3e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  62.5 
 
 
180 aa  226  2e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7237  GCN5-related N-acetyltransferase  56.9 
 
 
182 aa  204  4e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.354809  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6053  GCN5-related N-acetyltransferase  57.8 
 
 
180 aa  203  1e-51  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.134247  normal  0.286524 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3647  GCN5-related N-acetyltransferase  58.64 
 
 
182 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  58.64 
 
 
182 aa  197  5e-50  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0556271 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1103  putative phosphinothricin acetyltransferase  55.23 
 
 
190 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1689  GCN5-related N-acetyltransferase  54.07 
 
 
178 aa  194  5.000000000000001e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3435  GCN5-related N-acetyltransferase  54.44 
 
 
226 aa  194  6e-49  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0397  phosphinothricin acetyltransferase protein  56.1 
 
 
183 aa  190  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.456114  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
247 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
247 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
247 aa  189  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4184  acetyltransferase  54.02 
 
 
209 aa  189  2e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.337543  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1301  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
210 aa  189  2e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.314376  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  52.05 
 
 
197 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  52.33 
 
 
179 aa  188  2.9999999999999997e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1014  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
188 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0281887  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0284  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
247 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.511587  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0554  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.71 
 
 
247 aa  188  4e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.450037  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4059  GCN5-related N-acetyltransferase  52.57 
 
 
207 aa  187  8e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0540643  normal  0.214927 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3938  GCN5-related N-acetyltransferase  52.63 
 
 
181 aa  187  1e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.521347 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3365  GCN5-related N-acetyltransferase  52.35 
 
 
188 aa  186  2e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00313605  hitchhiker  0.0000000000000200087 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4023  GCN5-related N-acetyltransferase  54.44 
 
 
186 aa  186  2e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.210755  normal  0.806566 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  52.22 
 
 
185 aa  184  6e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1640  GCN5-related N-acetyltransferase  52.02 
 
 
176 aa  184  8e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.883223 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1467  phosphinothricin N-acetyltransferase  53.8 
 
 
188 aa  184  8e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5631  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.320484  normal  0.522089 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4517  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
187 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.729154  normal  0.542094 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3699  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4669  GCN5-related N-acetyltransferase  52 
 
 
186 aa  182  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.776305  normal  0.611211 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1401  GCN5-related N-acetyltransferase  50.29 
 
 
174 aa  181  4.0000000000000006e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3321  phosphinothricin N-acetyltransferase  52.63 
 
 
179 aa  181  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0173112  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  51.43 
 
 
186 aa  181  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  54.71 
 
 
185 aa  181  7e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2931  Phosphinothricin acetyltransferase  49.43 
 
 
178 aa  179  1e-44  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1460  GCN5-related N-acetyltransferase  48.84 
 
 
178 aa  180  1e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  52.02 
 
 
184 aa  179  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  50.29 
 
 
200 aa  178  2.9999999999999997e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  52.54 
 
 
176 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0680  GCN5-related N-acetyltransferase  54.29 
 
 
186 aa  175  3e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  52.05 
 
 
186 aa  175  3e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2733  GCN5-related N-acetyltransferase  49.14 
 
 
184 aa  175  4e-43  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.945518 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  48.85 
 
 
185 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  47.7 
 
 
200 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3356  GCN5-related N-acetyltransferase  49.12 
 
 
173 aa  172  2.9999999999999996e-42  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.378643 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1472  Phosphinothricin acetyltransferase  49.42 
 
 
174 aa  171  5e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2704  GCN5-related N-acetyltransferase  49.12 
 
 
173 aa  171  5.999999999999999e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.406059  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5346  GCN5-related N-acetyltransferase  49.12 
 
 
174 aa  170  7.999999999999999e-42  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1356  GCN5-related N-acetyltransferase  48.55 
 
 
181 aa  170  9e-42  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.181273  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1883  GCN5-related N-acetyltransferase  49.41 
 
 
197 aa  169  2e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.278862  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1369  Phosphinothricin acetyltransferase  52.8 
 
 
177 aa  168  4e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.108619  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00885  phosphinothricin N-acetyltransferase  50 
 
 
179 aa  166  1e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0203848  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1899  GCN5-related N-acetyltransferase  50.91 
 
 
167 aa  166  2e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.0856381  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2866  GCN5-related N-acetyltransferase  48.57 
 
 
195 aa  166  2e-40  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0345136 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3437  GCN5-related N-acetyltransferase  47.4 
 
 
206 aa  164  5e-40  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  49.71 
 
 
179 aa  164  6.9999999999999995e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  49.12 
 
 
179 aa  162  2.0000000000000002e-39  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  46.15 
 
 
180 aa  162  2.0000000000000002e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3655  Phosphinothricin acetyltransferase  46.11 
 
 
168 aa  161  5.0000000000000005e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2407  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
195 aa  161  6e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  48.54 
 
 
193 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3122  Phosphinothricin acetyltransferase  43.68 
 
 
176 aa  159  3e-38  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  46.24 
 
 
210 aa  152  2e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  48.45 
 
 
170 aa  151  4e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0386  Phosphinothricin acetyltransferase  49.03 
 
 
173 aa  151  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
165 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0225  GCN5-related N-acetyltransferase  42.2 
 
 
193 aa  142  3e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.296328 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3361  GCN5-related N-acetyltransferase  43.03 
 
 
168 aa  140  7e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.350433  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3936  GCN5-related N-acetyltransferase  48.85 
 
 
176 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0390446  decreased coverage  0.000407903 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4403  GCN5-related N-acetyltransferase  42.13 
 
 
192 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.561818 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0992  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 
191 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.552024 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0933  GCN5-related N-acetyltransferase  40.11 
 
 
204 aa  131  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  44.65 
 
 
168 aa  130  6.999999999999999e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0955  GCN5-related N-acetyltransferase  38.64 
 
 
204 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.830489  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2342  GCN5-related N-acetyltransferase  41.71 
 
 
180 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  38.04 
 
 
170 aa  128  5.0000000000000004e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4064  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
169 aa  127  7.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3131  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  39.31 
 
 
190 aa  127  8.000000000000001e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0929  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
186 aa  126  2.0000000000000002e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.568206 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  37.2 
 
 
163 aa  126  2.0000000000000002e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  36.26 
 
 
170 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2224  Phosphinothricin acetyltransferase  41.48 
 
 
198 aa  125  3e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.646523  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  42.33 
 
 
164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  42.33 
 
 
202 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  43.83 
 
 
172 aa  124  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3378  acetyltransferase  38.01 
 
 
180 aa  124  9e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1500  GCN5-related N-acetyltransferase  39.11 
 
 
184 aa  123  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2837  acetyltransferase  36.2 
 
 
170 aa  123  2e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000369165  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  43.21 
 
 
172 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2475  acetyltransferase, GNAT family  36.2 
 
 
170 aa  122  2e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357932  normal  0.684775 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2817  acetyltransferase, GNAT family  37.04 
 
 
170 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000095145 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  43.29 
 
 
169 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2857  acetyltransferase, GNAT family  37.04 
 
 
170 aa  122  3e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000726351  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>