More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_3167 on replicon NC_012856
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012856  Rpic12D_3167  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
171 aa  351  2.9999999999999997e-96  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3492  GCN5-related N-acetyltransferase  96.49 
 
 
171 aa  337  2.9999999999999998e-92  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4846  GCN5-related N-acetyltransferase  58.6 
 
 
171 aa  194  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.219263 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4724  GCN5-related N-acetyltransferase  58.6 
 
 
171 aa  194  6e-49  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00375427 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4903  GCN5-related N-acetyltransferase  59.24 
 
 
171 aa  194  7e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.449893  hitchhiker  0.00644876 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  58.54 
 
 
171 aa  192  1e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0702354 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64360  hypothetical protein  58.86 
 
 
172 aa  187  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.272704  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5587  hypothetical protein  58.86 
 
 
172 aa  187  8e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.495936  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4892  phosphinothricin N-acetyltransferase, putative  58.23 
 
 
180 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4433  GCN5-related N-acetyltransferase  57.23 
 
 
185 aa  186  2e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0583  GCN5-related N-acetyltransferase  56.36 
 
 
177 aa  185  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0377  GCN5-related N-acetyltransferase  53.37 
 
 
172 aa  177  4.999999999999999e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5129  GCN5-related N-acetyltransferase  53.05 
 
 
175 aa  172  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.601206  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5068  putative GNAT family acetyltransferase  56 
 
 
164 aa  172  2.9999999999999996e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.774942 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0694  GCN5-related N-acetyltransferase  55.62 
 
 
166 aa  170  6.999999999999999e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6404  GCN5-related N-acetyltransferase  53.05 
 
 
175 aa  168  4e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.111575  normal  0.507549 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0868  GCN5-related N-acetyltransferase  51.57 
 
 
169 aa  167  6e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0919602  normal  0.666809 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1243  GCN5-related N-acetyltransferase  51.52 
 
 
169 aa  167  8e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.722913  normal  0.335188 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1274  Phosphinothricin acetyltransferase  53.16 
 
 
168 aa  166  2e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.768034  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0996  GCN5-related N-acetyltransferase  50 
 
 
183 aa  165  2.9999999999999998e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2104  GCN5-related N-acetyltransferase  47.85 
 
 
171 aa  160  6e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0463  GCN5-related N-acetyltransferase  48.26 
 
 
178 aa  160  1e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.23018 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1596  acetyltransferase  48.77 
 
 
202 aa  159  2e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1649  acetyltransferase  48.77 
 
 
164 aa  158  3e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.336507  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3636  GCN5-related N-acetyltransferase  49.38 
 
 
165 aa  157  8e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1268  GCN5-related N-acetyltransferase  46.91 
 
 
164 aa  155  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1570  phosphinothricin acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.538734  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1705  phosphinothricin acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.667334  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1751  phosphinothricin acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.753499  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1770  phosphinothricin acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1708  phosphinothricin acetyltransferase  46.63 
 
 
171 aa  153  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0205864  normal  0.892296 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  49.06 
 
 
173 aa  153  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.949814  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1629  acetyltransferase  46.01 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2054  acetyltransferase, GNAT family  46.01 
 
 
193 aa  152  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000047072 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1534  acetyltransferase  46.01 
 
 
193 aa  151  5e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2211  GCN5-related N-acetyltransferase  46.01 
 
 
172 aa  151  5e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1725  acetyltransferase  45.4 
 
 
172 aa  150  7e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000562438 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1718  acetyltransferase, GNAT family  46.01 
 
 
193 aa  150  8e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2198  GCN5-related N-acetyltransferase  45.4 
 
 
172 aa  150  8.999999999999999e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.408413  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01405  predicted acyltransferase with acyl-CoA N-acyltransferase domain  45.4 
 
 
172 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01416  hypothetical protein  45.4 
 
 
172 aa  148  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2611  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
170 aa  148  4e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00815719  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2457  GCN5-related N-acetyltransferase  42.94 
 
 
167 aa  147  9e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2535  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.63 
 
 
170 aa  146  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0379071  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2857  acetyltransferase, GNAT family  40.85 
 
 
170 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000726351  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2817  acetyltransferase, GNAT family  40.85 
 
 
170 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000095145 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2815  acetyltransferase, GNAT family  40.24 
 
 
170 aa  143  1e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2837  acetyltransferase  38.41 
 
 
170 aa  142  2e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000369165  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2552  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
163 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2568  phosphinothricin N-acetyltransferase  40.24 
 
 
170 aa  142  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2604  GCN5-related N-acetyltransferase  40.51 
 
 
163 aa  142  2e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2159  GCN5-related N-acetyltransferase  47.88 
 
 
184 aa  141  5e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0147439  normal  0.386853 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2475  acetyltransferase, GNAT family  39.02 
 
 
170 aa  140  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.357932  normal  0.684775 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3983  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
178 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2779  GCN5-related N-acetyltransferase  44.17 
 
 
165 aa  139  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229182  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4258  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
182 aa  138  3e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.257172  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04066  N-acetyltransferase  45.09 
 
 
173 aa  135  2e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.691269  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0667  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
182 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1146  GCN5-related N-acetyltransferase  46.06 
 
 
182 aa  135  4e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1122  GCN5-related N-acetyltransferase  45.45 
 
 
184 aa  132  1.9999999999999998e-30  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0293431  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4837  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3760  GCN5-related N-acetyltransferase  43.64 
 
 
182 aa  132  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4882  GCN5-related N-acetyltransferase  43.21 
 
 
197 aa  132  3e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.256707  normal  0.880249 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2090  phosphinothricin acetyltransferase, putative  38.61 
 
 
164 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3133  putative antibiotic resistance (acetyltransferase) protein  43.03 
 
 
182 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1787  putative phosphinothricin N-acetyltransferase  42.59 
 
 
200 aa  127  8.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000010061 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0026  GCN5-related N-acetyltransferase  36.25 
 
 
164 aa  122  2e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5489  GCN5-related N-acetyltransferase  41.57 
 
 
176 aa  122  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385408  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1028  GCN5-related N-acetyltransferase  45.18 
 
 
182 aa  121  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.517814  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3354  GCN5-related N-acetyltransferase  38.01 
 
 
186 aa  121  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0487  N-acetyltransferase  43.54 
 
 
165 aa  120  9e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0012  GCN5-related N-acetyltransferase  40.48 
 
 
180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0867027 
 
 
-
 
NC_004310  BR0089  phosphinothricin N-acetyltransferase  39.38 
 
 
179 aa  117  6e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.32151  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1024  GCN5-related N-acetyltransferase  43.98 
 
 
182 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0087  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.75 
 
 
179 aa  115  3e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0196  GCN5-related N-acetyltransferase  40.12 
 
 
176 aa  115  3e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000695211  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0101  GCN5-related N-acetyltransferase  36.99 
 
 
193 aa  115  3e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1342  GCN5-related N-acetyltransferase  41.18 
 
 
185 aa  114  5e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.327917  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  40.99 
 
 
185 aa  114  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3735  GCN5-related N-acetyltransferase  39.88 
 
 
185 aa  114  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3272  GCN5-related N-acetyltransferase  39.76 
 
 
210 aa  114  6.9999999999999995e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0201  GCN5-related N-acetyltransferase  39.75 
 
 
174 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.814424 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3155  GCN5-related N-acetyltransferase  38.51 
 
 
179 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.145568  normal  0.116738 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0288  GCN5-related N-acetyltransferase  41.32 
 
 
205 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.104009  normal  0.0123555 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0528  GCN5-related N-acetyltransferase  38.65 
 
 
181 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5144  Phosphinothricin acetyltransferase  39.75 
 
 
170 aa  112  3e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.324669  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3390  phosphinothricin acetyltransferase  39.51 
 
 
179 aa  112  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.598414  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1423  phosphinothricin acetyltransferase  39.51 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2440  phosphinothricin acetyltransferase  39.51 
 
 
179 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.725333  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1187  phosphinothricin acetyltransferase  39.51 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1914  phosphinothricin acetyltransferase  39.51 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2279  acetyltransferase  39.51 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.361482  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2318  acetyltransferase  39.51 
 
 
168 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4058  GCN5-related N-acetyltransferase  39.26 
 
 
200 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1606  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0984019  normal  0.573216 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1154  GCN5-related N-acetyltransferase  40.49 
 
 
186 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0181286  normal  0.493902 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2530  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.89 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2156  phosphinothricin acetyltransferase  38.89 
 
 
168 aa  108  3e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1352  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.89 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.207471  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1274  phosphinothricin N-acetyltransferase  38.89 
 
 
247 aa  108  3e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>