111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0120 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0120  hypothetical protein  100 
 
 		 164 aa  329  1e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.856496 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3290  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 		 193 aa  142  2e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2619  GCN5-related N-acetyltransferase  50.33 
 
 		 161 aa  138  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.478399  normal  0.502801 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1347  GCN5-related N-acetyltransferase  45.89 
 
 		 177 aa  136  1e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1339  GCN5-related N-acetyltransferase  41.61 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2008  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 		 185 aa  127  7.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.146585  normal  0.318743 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1981  GCN5-related N-acetyltransferase  41.51 
 
 		 185 aa  125  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2685  GCN5-related N-acetyltransferase  36.02 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0341972  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0749  GCN5-related N-acetyltransferase  41.72 
 
 		 255 aa  117  9e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4956  GCN5-related N-acetyltransferase  35.33 
 
 		 160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0738  GCN5-related N-acetyltransferase  41.88 
 
 		 177 aa  107  5e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2451  GCN5-related N-acetyltransferase  36.31 
 
 		 259 aa  107  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.607994  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0183  acetyltransferase  40.27 
 
 		 160 aa  105  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5800  GCN5-related N-acetyltransferase  40.14 
 
 		 280 aa  106  2e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.476968 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0673  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 		 156 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.974878  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3172  GCN5-related N-acetyltransferase  39.74 
 
 		 166 aa  104  5e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.13673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4985  GCN5-related N-acetyltransferase  41.67 
 
 		 174 aa  100  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4255  GCN5-related N-acetyltransferase  39.61 
 
 		 181 aa  100  1e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.179135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03213  acetyltransferase  39.74 
 
 		 176 aa  93.6  1e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1452  GCN5-related N-acetyltransferase  44.38 
 
 		 210 aa  90.1  1e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1015  GCN5-related N-acetyltransferase  41.5 
 
 		 195 aa  89.4  2e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00567741  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1665  GCN5-related N-acetyltransferase  32.05 
 
 		 173 aa  87.8  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.232999  normal  0.571399 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1095  GCN5-related N-acetyltransferase  35.53 
 
 		 167 aa  82.8  0.000000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.714441 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3491  GCN5-related N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 164 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.316028 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4879  GCN5-related N-acetyltransferase  33.11 
 
 		 163 aa  67.8  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.132099  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0225  putative acetyltransferase  31.61 
 
 		 157 aa  67  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7108  GCN5-related N-acetyltransferase  36.62 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.450507  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4390  GCN5-related N-acetyltransferase  33.76 
 
 		 145 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0166  GCN5-related N-acetyltransferase  28.95 
 
 		 162 aa  61.6  0.000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3330  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  30.07 
 
 		 170 aa  60.5  0.000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00421895 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2832  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 		 153 aa  59.3  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5072  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5788  GCN5-related N-acetyltransferase  32.48 
 
 		 145 aa  58.2  0.00000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3082  GCN5-related N-acetyltransferase  32.65 
 
 		 145 aa  57.8  0.00000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1914  GCN5-related N-acetyltransferase  30.97 
 
 		 167 aa  57.8  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0164  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 162 aa  57.4  0.00000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0148  GCN5-related N-acetyltransferase  30.92 
 
 		 163 aa  57  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.261026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5064  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  28.48 
 
 		 149 aa  55.8  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.153314  normal  0.331512 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4191  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 162 aa  55.5  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5431  hypothetical protein  31.08 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.519598 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0168  GCN5-related N-acetyltransferase  27.22 
 
 		 162 aa  53.5  0.000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0894462 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4423  acetyltransferase  26.43 
 
 		 175 aa  52  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0675  GCN5-related N-acetyltransferase  24.16 
 
 		 143 aa  52.4  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0558  putative acetyltransferase  25 
 
 		 160 aa  51.6  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.593494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1990  acetyltransferase  34.09 
 
 		 155 aa  51.2  0.000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000000227109  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4269  GCN5-related N-acetyltransferase  27.34 
 
 		 145 aa  51.2  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1957  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 154 aa  50.8  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000038315  normal  0.253297 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2087  GCN5-related N-acetyltransferase  33.71 
 
 		 154 aa  50.4  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000114873  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6390  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 151 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517471  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0556  hypothetical protein  22.3 
 
 		 176 aa  48.9  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.154761  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2187  acetyltransferase  30.2 
 
 		 155 aa  48.5  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.396795  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3407  GCN5-related N-acetyltransferase  30.34 
 
 		 165 aa  47.8  0.00007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.204713  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4926  GCN5-related N-acetyltransferase  27.78 
 
 		 157 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0117  hypothetical protein  27.03 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0103  hypothetical protein  27.03 
 
 		 286 aa  47  0.0001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3572  GCN5-related N-acetyltransferase  29.88 
 
 		 283 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6022  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000365259  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2055  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 154 aa  47  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000246116  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3552  GCN5-related N-acetyltransferase  28.57 
 
 		 165 aa  47  0.0001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3500  acetyltransferase  28.57 
 
 		 166 aa  47  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.867974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1221  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 204 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000959318  normal  0.163297 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003254  probable acetyltransferase  27.36 
 
 		 113 aa  45.8  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2494  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 154 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000111542  hitchhiker  0.00933544 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2480  acetyltransferase  31.46 
 
 		 155 aa  45.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00000000023869  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2074  GCN5-related N-acetyltransferase  32.58 
 
 		 230 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000267739  normal  0.205343 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1376  GCN5-related N-acetyltransferase  32.56 
 
 		 154 aa  45.4  0.0003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000841135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4353  GCN5-related N-acetyltransferase  48.08 
 
 		 241 aa  45.8  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.734146  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1596  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00000143194  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2620  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000567167  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5364  acetyltransferase  30.43 
 
 		 154 aa  45.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000322188  normal  0.672145 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2098  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000287882  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3215  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000000494866  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2534  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.506503  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1371  acetyltransferase  31.82 
 
 		 155 aa  45.1  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.000000926886  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1643  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000157541  normal  0.0551076 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0919  putative acetyltransferase  35.35 
 
 		 172 aa  44.3  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.240492  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  26.53 
 
 		 145 aa  44.3  0.0007  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003291  probable acetyltransferase  27.36 
 
 		 113 aa  44.3  0.0008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2416  GCN5-related N-acetyltransferase  29.89 
 
 		 141 aa  44.3  0.0008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.336219  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2132  diamine acetyltransferase  32.18 
 
 		 178 aa  43.5  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.105649  normal  0.341096 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3186  GCN5-related N-acetyltransferase  23.74 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230129  normal  0.0101045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2656  GCN5-related N-acetyltransferase  27.59 
 
 		 181 aa  43.9  0.001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.312645  hitchhiker  0.00701873 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2265  GCN5-related N-acetyltransferase  30.77 
 
 		 160 aa  43.5  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4463  GCN5-related N-acetyltransferase  25.34 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3814  GCN5-related N-acetyltransferase  36.36 
 
 		 177 aa  42.7  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00104394 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09760  acetyltransferase (GNAT) family protein  30.39 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.257332  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1948  GCN5-related N-acetyltransferase  33.85 
 
 		 285 aa  42.7  0.002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3377  GCN5-related N-acetyltransferase  36.71 
 
 		 143 aa  43.1  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0291  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  31.82 
 
 		 147 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0664508  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3183  GCN5-related N-acetyltransferase  25.53 
 
 		 148 aa  43.1  0.002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.658111  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1326  GCN5-related N-acetyltransferase  32.2 
 
 		 169 aa  42.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.160898  normal  0.179627 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1739  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 		 160 aa  42.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.197201  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2999  GCN5-related N-acetyltransferase  34.48 
 
 		 155 aa  42.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0245  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  29.27 
 
 		 159 aa  42  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0192  acetyltransferase  30.43 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1854  GCN5-related N-acetyltransferase  30.33 
 
 		 287 aa  41.6  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.794168  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1021  acetyltransferase  28 
 
 		 173 aa  41.6  0.005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.179395  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1171  GCN5-related N-acetyltransferase  28.66 
 
 		 283 aa  41.6  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.140148 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5033  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  30.68 
 
 		 147 aa  41.6  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.708408  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>