48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4638 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4638  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
222 aa  442  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7218  GCN5-related N-acetyltransferase  56.67 
 
 
213 aa  245  4e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.998614 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  53.81 
 
 
220 aa  218  3.9999999999999997e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2791  GCN5-related N-acetyltransferase  52.86 
 
 
212 aa  197  7.999999999999999e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.524261  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0531  GCN5-related protein N-acetyltransferase  35.83 
 
 
208 aa  95.9  4e-19  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.101247  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3000  GCN5-related N-acetyltransferase  36.22 
 
 
201 aa  92.8  4e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0742663  normal  0.331805 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1790  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
231 aa  90.9  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.242813  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4707  GCN5-related N-acetyltransferase  34.36 
 
 
203 aa  87.8  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0617246  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5497  GCN5-related N-acetyltransferase  34.05 
 
 
214 aa  80.5  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.0000151492  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0622  GCN5-related N-acetyltransferase  32.18 
 
 
210 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02530  acetyltransferase  31.31 
 
 
221 aa  75.5  0.0000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.777056  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0813  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
210 aa  73.9  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.600223 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0958  GCN5-related N-acetyltransferase  32.62 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1027  GCN5-related N-acetyltransferase  33.67 
 
 
208 aa  71.6  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.406805  normal  0.416971 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3275  GCN5-related N-acetyltransferase  37.77 
 
 
217 aa  69.7  0.00000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0761578 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0737  GCN5-related N-acetyltransferase  34.92 
 
 
219 aa  66.2  0.0000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.970518 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1305  GCN5-related N-acetyltransferase  26.2 
 
 
204 aa  65.1  0.0000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0153  GCN5-related N-acetyltransferase  30.96 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0226769 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0302  GCN5-related N-acetyltransferase  26.9 
 
 
226 aa  63.5  0.000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00317404  normal  0.0799447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1160  GCN5-related N-acetyltransferase  32.28 
 
 
202 aa  63.9  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.719093  normal  0.919824 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1217  GCN5-related N-acetyltransferase  25.39 
 
 
204 aa  53.9  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1054  putative acetyltransferase  32.89 
 
 
164 aa  48.1  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1813  Phosphinothricin acetyltransferase  39.71 
 
 
198 aa  47  0.0002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.66102  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2725  mycothiol biosynthesis acetyltransferase  38.89 
 
 
323 aa  46.6  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00719898 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0245  GCN5-related N-acetyltransferase  38.24 
 
 
203 aa  45.1  0.0008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1295  GCN5-related N-acetyltransferase  35.37 
 
 
164 aa  45.1  0.0009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.476668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4712  acetyltransferase, GNAT family  34.25 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0625  acetyltransferase, GNAT family  34.25 
 
 
168 aa  44.7  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1763  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  28.85 
 
 
138 aa  44.7  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0500  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 
168 aa  44.3  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3013  GCN5-related N-acetyltransferase  35.29 
 
 
323 aa  44.3  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.624033  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0858  MarR family transcriptional regulator  45.1 
 
 
320 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0762  MarR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
347 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0446  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  34.62 
 
 
147 aa  43.1  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3486  transcriptional regulator, MarR family with acetyltransferase activity  45.28 
 
 
349 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3457  GCN5-related N-acetyltransferase  37.84 
 
 
112 aa  42.4  0.006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2338  GCN5-related N-acetyltransferase  32.84 
 
 
177 aa  42  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.174627  normal  0.315018 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1552  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  37.7 
 
 
147 aa  41.6  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29220  acetyltransferase  32.76 
 
 
219 aa  42  0.008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3555  MarR family transcriptional regulator  43.4 
 
 
349 aa  41.6  0.009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.33 
 
 
148 aa  41.6  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>