More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3051 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_3051  Rhodanese domain protein  100 
 
 
272 aa  538  9.999999999999999e-153  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0410601  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1776  Rhodanese domain protein  60.15 
 
 
335 aa  294  1e-78  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.305984  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0354  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  54.98 
 
 
285 aa  261  1e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5179  Rhodanese domain protein  51.49 
 
 
283 aa  244  9.999999999999999e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06480  rhodanese-related sulfurtransferase  53.75 
 
 
310 aa  242  3.9999999999999997e-63  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0593  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.94 
 
 
285 aa  197  2.0000000000000003e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1326  Rhodanese domain protein  45.23 
 
 
283 aa  191  2e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0377463  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0726  rhodanese domain-containing protein  44.68 
 
 
291 aa  187  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.893447  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  42.5 
 
 
278 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3367  rhodanese domain-containing protein  44.13 
 
 
312 aa  186  3e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2489  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.73 
 
 
282 aa  184  9e-46  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0321  rhodanese domain-containing protein  43.88 
 
 
288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.183819 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1708  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.49 
 
 
276 aa  181  8.000000000000001e-45  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3952  rhodanese domain-containing protein  45.49 
 
 
290 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3246  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  48 
 
 
289 aa  178  9e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0068458 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3212  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.53 
 
 
299 aa  177  1e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.389078  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0177  Rhodanese domain-containing protein  43.93 
 
 
278 aa  176  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000691288  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2019  ketopantoate reductase ApbA/PanE  44.7 
 
 
627 aa  176  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.691708  normal  0.348803 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2635  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  42.29 
 
 
278 aa  176  3e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.273027  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0188  Rhodanese domain protein  46.04 
 
 
285 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1239  Rhodanese domain protein  42.14 
 
 
284 aa  176  5e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.954881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4306  Rhodanese domain protein  42.54 
 
 
272 aa  176  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.913868  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4824  rhodanese domain-containing protein  46.27 
 
 
289 aa  175  8e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0196782  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1466  Rhodanese domain protein  44.66 
 
 
282 aa  172  3.9999999999999995e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0394652  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3772  rhodanese domain-containing protein  46.72 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.0206148 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07810  rhodanese-related sulfurtransferase  44.15 
 
 
375 aa  171  7.999999999999999e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2636  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  44.17 
 
 
292 aa  172  7.999999999999999e-42  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.488566  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1426  Rhodanese domain protein  38.64 
 
 
276 aa  171  1e-41  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.630889  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3485  rhodanese domain-containing protein  36.36 
 
 
278 aa  170  2e-41  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2620  rhodanese-like protein  43.23 
 
 
285 aa  169  3e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1048  Rhodanese domain protein  42.8 
 
 
281 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.11236 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3652  rhodanese domain-containing protein  46.94 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.865325  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4490  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.94 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3875  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.94 
 
 
289 aa  169  6e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.403807 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5118  rhodanese domain protein  42.75 
 
 
284 aa  167  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1745  rhodanese-like domain protein  38.49 
 
 
277 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000561696  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1631  Rhodanese domain protein  45.17 
 
 
291 aa  167  2e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00167409  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2381  rhodanese domain-containing protein  43.46 
 
 
275 aa  167  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.305388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2038  Rhodanese domain protein  43.03 
 
 
295 aa  167  2e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1705  rhodanese-like domain-containing protein  38.13 
 
 
277 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0165982  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0610  rhodanese domain-containing protein  42.15 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2431  Rhodanese domain protein  43.43 
 
 
295 aa  166  4e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1310  rhodanese domain-containing protein  37.22 
 
 
276 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.965267  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3069  Rhodanese domain protein  46.3 
 
 
277 aa  165  9e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.597651 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2623  rhodanese domain-containing protein  40.53 
 
 
283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1669  rhodanese-like domain protein  37.77 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1483  rhodanese-like domain-containing protein  37.77 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.77 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1599  rhodanese-like domain-containing protein  37.77 
 
 
277 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.317702  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2427  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.75 
 
 
280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.244086 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1994  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  45.23 
 
 
286 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1455  thiosulfate sulfurtransferase  37.77 
 
 
277 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3055  rhodanese-like protein  41.01 
 
 
279 aa  163  2.0000000000000002e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.403851  normal  0.0127336 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2596  Rhodanese domain protein  45.42 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.126951  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0325  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0847  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.641684  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0359  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2397  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2539  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.920072  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1507  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1701  rhodanese domain-containing protein  41.76 
 
 
289 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1779  rhodanese-like protein  38.06 
 
 
272 aa  162  6e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0268693  normal  0.617772 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1634  rhodanese-like domain protein  38.13 
 
 
277 aa  162  6e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0494002  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29210  rhodanese-related sulfurtransferase  41.26 
 
 
297 aa  162  6e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6785  Rhodanese domain protein  42.75 
 
 
289 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0412413  hitchhiker  0.0000256266 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2918  thiosulfate sulfurtransferase  40.28 
 
 
276 aa  162  6e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0877  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.78 
 
 
287 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00777  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.03 
 
 
290 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0224116  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4992  rhodanese domain-containing protein  41.64 
 
 
284 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3711  rhodanese-like domain protein  37.41 
 
 
277 aa  160  2e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.584837  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2831  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  43.13 
 
 
289 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2215  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  46.28 
 
 
289 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0556  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  35.34 
 
 
276 aa  159  3e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.593662 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1498  rhodanese domain-containing protein  37.05 
 
 
277 aa  160  3e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.125768  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0347  rhodanese domain-containing protein  41.95 
 
 
284 aa  159  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.772652  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_32980  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase protein  46.96 
 
 
284 aa  159  4e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3515  thiosulfate sulfurtransferase  44.44 
 
 
278 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.432298  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27500  rhodanese-related sulfurtransferase  40.31 
 
 
280 aa  158  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1319  Rhodanese domain protein  39.64 
 
 
300 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.147779  normal  0.429606 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1872  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 
274 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.494935  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7064  thiosulfate sulfurtransferase  42.35 
 
 
270 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.508402  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1846  Rhodanese domain protein  38.81 
 
 
274 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5168  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
284 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3646  Rhodanese domain protein  38.83 
 
 
276 aa  155  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1460  rhodanese domain-containing protein  43.18 
 
 
288 aa  155  9e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.058733  normal  0.145252 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2226  thiosulfate sulfurtransferase protein  40.55 
 
 
296 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0305  Rhodanese domain protein  41.39 
 
 
285 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5343  3-mercaptopyruvate sulfurtransferase  39.11 
 
 
284 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0420  rhodanese-like domain protein  39.48 
 
 
285 aa  152  5e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1421  rhodanese domain-containing protein  41.92 
 
 
288 aa  152  7e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.692836  decreased coverage  0.00000340615 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2346  rhodanese domain-containing protein  36.94 
 
 
272 aa  151  8.999999999999999e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0952  Rhodanese domain protein  41.44 
 
 
284 aa  151  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.63885  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2415  ketopantoate reductase ApbA/PanE-like  43.19 
 
 
687 aa  151  1e-35  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.427729  normal  0.379727 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0677  Rhodanese domain protein  44.57 
 
 
299 aa  151  1e-35  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1769  rhodanese domain-containing protein  41.26 
 
 
284 aa  151  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000405789  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3608  Rhodanese domain protein  42.69 
 
 
279 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0580281  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5604  Rhodanese domain protein  42.56 
 
 
287 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1417  thiosulfate sulfurtransferase  39.03 
 
 
289 aa  150  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0631  Rhodanese domain protein  38.52 
 
 
305 aa  150  3e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0797433  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2370  Rhodanese domain protein  44.32 
 
 
298 aa  149  6e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000188451 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>