12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS00374 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS00374  hypothetical protein  100 
 
 		 407 aa  826    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4988  hypothetical protein  83 
 
 		 412 aa  692    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0891  hypothetical protein  51.98 
 
 		 412 aa  439  9.999999999999999e-123  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.571555  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2728  hypothetical protein  32.23 
 
 		 300 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00309859  normal  0.614754 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00431  hypothetical protein  26.71 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47513  predicted protein  26.69 
 
 		 717 aa  65.1  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6202  hypothetical protein  45.9 
 
 		 171 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32405  predicted protein  24.48 
 
 		 237 aa  55.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0453  hypothetical protein  44 
 
 		 186 aa  50.4  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.597962  hitchhiker  0.00422239 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3346  hypothetical protein  40.74 
 
 		 89 aa  49.7  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4198  Protein of unknown function DUF2087  25.6 
 
 		 178 aa  43.9  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3787  Protein of unknown function DUF2087  36 
 
 		 96 aa  43.5  0.006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.666122  normal  0.228375 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>