112 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1556 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011898  Ccel_1556  putative transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 		 102 aa  206  8e-53  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0550  putative transcriptional regulator, ArsR family  39.58 
 
 		 119 aa  52.8  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0563  ArsR family transcriptional regulator  30.53 
 
 		 132 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2665  transcriptional regulator, ArsR family  31.65 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.374254  normal  0.232487 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3338  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2915  ArsR family transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  49.3  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3014  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 119 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0824395  normal  0.0135705 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2058  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3223  regulatory protein, ArsR  29.9 
 
 		 122 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.741691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3471  regulatory protein, ArsR  26.32 
 
 		 135 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.508363 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3045  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1580  regulatory protein, ArsR  29.7 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2999  ArsR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 130 aa  47.8  0.00005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14310  putative transcriptional regulator  34.04 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.287789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5422  transcriptional regulator, ArsR family  27.66 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.424313 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2780  hypothetical protein  34.65 
 
 		 99 aa  47  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3421  regulatory protein, ArsR  27.72 
 
 		 105 aa  47  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.993799  normal  0.836004 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2532  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 122 aa  47  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.76201  normal  0.471472 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56620  hypothetical protein  37.37 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3742  ArsR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.102941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1500  ArsR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 100 aa  47  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.574004  normal  0.560617 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4925  hypothetical protein  37.37 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3183  ArsR family transcriptional regulator  34.18 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  decreased coverage  0.00771422  normal  0.767767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2017  ArsR family transcriptional regulator  36 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0103246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2339  ArsR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.479129  normal  0.428363 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3217  regulatory protein, ArsR  28.09 
 
 		 95 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3468  ArsR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1121  ArsR family transcriptional regulator  33.67 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.534807 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2454  transcriptional regulator, ArsR family  32.61 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0571  transcriptional regulator, ArsR family  33.98 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1745  putative transcriptional regulator, ArsR family  33.67 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0405672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0794  regulatory protein ArsR  29 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2685  regulatory protein ArsR  29.17 
 
 		 120 aa  45.8  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0240981  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4155  transcriptional regulator, ArsR family  26.8 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1556  ArsR family transcriptional regulator  31.52 
 
 		 125 aa  45.4  0.0003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.157609  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3241  ArsR family transcriptional regulator  35.44 
 
 		 104 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0345  ArsR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 127 aa  45.1  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1441  ArsR family transcriptional regulator  26.8 
 
 		 120 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.541049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1658  regulatory protein, ArsR  27.55 
 
 		 183 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.214352  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  26.32 
 
 		 270 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3423  transcriptional regulator, ArsR family  26 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8609  transcriptional regulator, ArsR family  28.12 
 
 		 118 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0122509  normal  0.498066 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02010  transcriptional regulator, ArsR family  26 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4723  transcriptional regulator, ArsR family  27.55 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.383157  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3239  ArsR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 136 aa  43.9  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.366453 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2223  regulatory protein, ArsR  35.14 
 
 		 104 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.539963  normal  0.22354 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_26420  transcriptional regulator, ArsR family  26.97 
 
 		 109 aa  43.9  0.0008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.169574 
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4201  ArsR family transcriptional regulator  25 
 
 		 94 aa  43.5  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.314782  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0435  ArsR family transcriptional regulator  25.77 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1969  ArsR family transcriptional regulator  26.73 
 
 		 123 aa  43.5  0.0009  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.409098  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2453  ArsR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 96 aa  43.5  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.463761  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12660  ArsR family transcriptional regulator  27.96 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000762014  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1441  regulatory protein ArsR  28.89 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1908  regulatory protein ArsR  31.52 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5804  transcriptional regulator, ArsR family  36 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.832353  normal  0.28843 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1460  regulatory protein ArsR  30.43 
 
 		 100 aa  43.5  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.481156  normal  0.479599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2679  regulatory protein ArsR  26.88 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.00320886  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3653  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 111 aa  42.4  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.208481  normal  0.0510455 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1348  ArsR family transcriptional regulator  33.72 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.208543  normal  0.0554096 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2337  ArsR family transcriptional regulator  25.47 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.860485  normal  0.0718048 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3822  regulatory protein, ArsR  25.47 
 
 		 95 aa  42.7  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2235  transcriptional regulator, ArsR family  28.41 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.167964  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3544  transcriptional regulator, ArsR family  23.08 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.58934  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2392  transcriptional regulator, ArsR family  29.7 
 
 		 117 aa  42.7  0.002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1925  putative transcriptional regulator, ArsR family  26.73 
 
 		 118 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31180  transcriptional regulator, ArsR family  26.47 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1989  transcriptional regulator, ArsR family  27.55 
 
 		 125 aa  42.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.746308  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4523  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0493  transcriptional regulator  32.1 
 
 		 117 aa  42  0.003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.877737 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4610  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4906  ArsR family transcriptional regulator  28.09 
 
 		 125 aa  42  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1652  regulatory protein, ArsR  35.71 
 
 		 119 aa  42  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.000800297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12658  ArsR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 119 aa  42  0.003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000059483  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4809  ArsR family transcriptional regulator  37.76 
 
 		 109 aa  42  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.697625  normal  0.276728 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3347  transcriptional regulator, ArsR family  27.96 
 
 		 120 aa  41.6  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14690  transcriptional regulator, ArsR family  33.33 
 
 		 116 aa  42  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1522  ArsR family transcriptional regulator  32.38 
 
 		 165 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.573831  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1433  ArsR family transcriptional regulator  26.44 
 
 		 105 aa  41.2  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.662802 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1218  regulatory protein, ArsR  26.47 
 
 		 100 aa  41.2  0.004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3384  regulatory protein, ArsR  30.69 
 
 		 100 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.992781  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4499  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.43 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0587  putative transcriptional regulator  27.91 
 
 		 114 aa  41.6  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0205  transcriptional regulator, ArsR family  30.21 
 
 		 110 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.397651 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2723  putative transcriptional regulator, ArsR family  31.37 
 
 		 97 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0152441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3657  transcriptional regulator, ArsR family  29.76 
 
 		 127 aa  41.6  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18440  predicted transcriptional regulator  37.5 
 
 		 108 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.347123 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0788  regulatory protein ArsR  25.81 
 
 		 120 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1291  ArsR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 121 aa  41.2  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  hitchhiker  0.00000700515  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4825  regulatory protein, ArsR  28.41 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.114611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2949  regulatory protein, ArsR  32.47 
 
 		 126 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.394398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4051  regulatory protein, ArsR  31 
 
 		 104 aa  40.8  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.125954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4149  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0126  regulatory protein, ArsR  28.12 
 
 		 125 aa  40.8  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0148  ArsR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4674  ArsR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 102 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2984  putative transcriptional regulator, ArsR family  30.85 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7744  transcriptional regulator, ArsR family  30.36 
 
 		 113 aa  40.8  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0952  ArsR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4243  ArsR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 103 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.263403 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1191  transcriptional regulator, ArsR family  29.47 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000014482  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>