14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4276 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4276  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
261 aa  508  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3118  DNA polymerase beta domain protein region  75.22 
 
 
226 aa  346  2e-94  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1495  DNA polymerase beta domain protein region  43.19 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2550  DNA polymerase beta domain protein region  36.49 
 
 
230 aa  137  2e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0464694 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2688  DNA polymerase beta domain protein region  36.32 
 
 
229 aa  119  4.9999999999999996e-26  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.373799  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0234  DNA polymerase beta domain protein region  30.92 
 
 
265 aa  92.4  7e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.126142  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0250  catalase-peroxidase  23.19 
 
 
749 aa  48.9  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0545  DNA polymerase beta subunit  37.97 
 
 
128 aa  48.5  0.0001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2213  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.87 
 
 
300 aa  45.8  0.0008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.462886  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1925  nucleotidyltransferase domain-containing protein  33.87 
 
 
300 aa  45.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0252  catalase-peroxidase  22.22 
 
 
749 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1067  DNA polymerase beta domain protein region  28.85 
 
 
255 aa  43.5  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.164876 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1565  DNA polymerase, beta-like region  34.34 
 
 
111 aa  42.7  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  44 
 
 
104 aa  42.7  0.006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>