15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2688 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2688  hypothetical protein  100 
 
 		 212 aa  427  1e-119  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.100137  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0129  hypothetical protein  43.52 
 
 		 216 aa  159  3e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37660  hypothetical protein  41.83 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3211  hypothetical protein  35.53 
 
 		 355 aa  117  9e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.619759  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2886  DNA polymerase beta domain protein region  31.98 
 
 		 223 aa  96.7  3e-19  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0103  DNA polymerase beta subunit  27.93 
 
 		 206 aa  63.5  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0007  DNA polymerase beta subunit  26.78 
 
 		 209 aa  48.9  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5390  DNA polymerase beta domain protein region  30.08 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.536785  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4942  regulatory protein ArsR  26.67 
 
 		 199 aa  45.1  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.480424  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0359  DNA polymerase, beta-like region  29.03 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0842  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 196 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0461071  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0814  DNA polymerase beta subunit  29.03 
 
 		 185 aa  44.7  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.626754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2615  DNA polymerase beta subunit  28.21 
 
 		 195 aa  43.5  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506514  normal  0.0510048 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0094  hypothetical protein  27.1 
 
 		 192 aa  42  0.006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1397  DNA polymerase beta subunit  28.97 
 
 		 171 aa  41.6  0.009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>