27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tneu_0503 on replicon NC_010525
Organism: Thermoproteus neutrophilus V24Sta



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 141 aa  287  4e-77  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  76 
 
 		 103 aa  164  2.9999999999999998e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  42.39 
 
 		 110 aa  76.3  0.0000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  42.11 
 
 		 121 aa  66.2  0.0000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 		 113 aa  64.7  0.0000000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  39.36 
 
 		 111 aa  58.5  0.00000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  38.14 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  60 
 
 		 80 aa  56.2  0.0000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0489  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 111 aa  55.8  0.0000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1459  DNA polymerase beta subunit  42 
 
 		 113 aa  54.7  0.0000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  39.29 
 
 		 112 aa  53.9  0.0000007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  35.56 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  35.79 
 
 		 122 aa  51.2  0.000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1433  DNA polymerase beta subunit  36.05 
 
 		 133 aa  50.1  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.855989  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 		 109 aa  48.1  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  30.39 
 
 		 114 aa  48.5  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 113 aa  47.8  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1397  DNA polymerase, beta-like region  33.87 
 
 		 113 aa  43.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0494  DNA polymerase beta subunit  46.94 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1577  DNA polymerase, beta-like region  28 
 
 		 104 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000241752  normal  0.133279 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  27.08 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1028  DNA polymerase beta domain protein region  28.77 
 
 		 111 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000000129156  normal  0.703188 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  30.95 
 
 		 105 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1154  DNA polymerase beta subunit  32.35 
 
 		 147 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.855122  normal  0.0599495 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  36.21 
 
 		 122 aa  40.4  0.009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0317  DNA polymerase beta domain protein region  24.14 
 
 		 121 aa  40  0.01  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>