15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1278 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 113 aa  229  8.000000000000001e-60  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2681  DNA polymerase beta domain protein region  63.25 
 
 		 114 aa  141  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0999  DNA polymerase beta subunit  61.95 
 
 		 114 aa  138  3e-32  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0343888  hitchhiker  0.00940331 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1689  DNA polymerase beta subunit  55.36 
 
 		 122 aa  130  7.999999999999999e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  hitchhiker  0.0000949041  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0991  DNA polymerase beta subunit  55.36 
 
 		 111 aa  115  9.999999999999999e-26  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1435  DNA polymerase beta subunit  41.41 
 
 		 109 aa  82.4  0.000000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.00000000437505  decreased coverage  0.0000020199 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1268  DNA polymerase beta subunit  50.57 
 
 		 110 aa  80.1  0.00000000000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.834804 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0718  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.525185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  31.58 
 
 		 110 aa  51.2  0.000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1566  DNA polymerase beta subunit  36.17 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.717428  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  30 
 
 		 141 aa  47.8  0.00006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 80 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  37.8 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0464  DNA polymerase beta subunit  45.28 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0242812  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  27.96 
 
 		 103 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>