9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1476 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008701  Pisl_1476  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 80 aa  166  7e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0506  DNA polymerase beta subunit  82.76 
 
 		 121 aa  100  5e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00399144 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 110 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  60 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  50 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2209  DNA polymerase beta domain protein region  37.93 
 
 		 113 aa  51.2  0.000004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1278  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2718  DNA polymerase, beta-like region  46 
 
 		 109 aa  41.2  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000888869  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1697  DNA polymerase beta subunit  42.5 
 
 		 92 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.00000599045  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>