12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2455 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2455  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 110 aa  218  3e-56  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.347866  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0336  DNA polymerase beta domain protein region  33.03 
 
 		 122 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.712682  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1132  DNA polymerase beta subunit  37.23 
 
 		 114 aa  67.8  0.00000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0503  DNA polymerase beta subunit  35.71 
 
 		 141 aa  46.2  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00191521 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3062  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 		 189 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0218  DNA polymerase beta subunit  48.78 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0251  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 110 aa  40.8  0.006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0736042  normal  0.344396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1038  DNA polymerase beta subunit  53.85 
 
 		 118 aa  40.4  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0191145  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1067  DNA polymerase beta subunit  29.51 
 
 		 108 aa  40.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.485724  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1133  DNA polymerase beta subunit  40.48 
 
 		 123 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1301  DNA polymerase beta subunit  38.71 
 
 		 103 aa  40  0.01  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1028  DNA polymerase beta subunit  39.66 
 
 		 94 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.261092  normal  0.357302 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>