12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4099 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4099  hypothetical protein  100 
 
 		 129 aa  262  1e-69  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.41555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3654  hypothetical protein  79.49 
 
 		 137 aa  187  5e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.544333  normal  0.731043 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  24.07 
 
 		 146 aa  49.3  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  28.97 
 
 		 146 aa  48.5  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1999  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 		 155 aa  47.8  0.00006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.95495  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0882  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 156 aa  42.7  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000293265 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3015  DNA polymerase beta subunit  25.66 
 
 		 142 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.914629  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3257  DNA polymerase, beta-like region  30.77 
 
 		 132 aa  40.8  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00329127  hitchhiker  2.42256e-16 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0178  DNA polymerase, beta-like region  32.35 
 
 		 163 aa  40.8  0.007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0107452  normal  0.933077 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0658  DNA polymerase beta subunit  31.91 
 
 		 137 aa  40.4  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000311195  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4528  DNA polymerase beta subunit  24.03 
 
 		 152 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.373361  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1589  DNA polymerase beta domain protein region  26.09 
 
 		 132 aa  40  0.01  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.382693  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>