34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_1484 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_1484  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 119 aa  243  9e-64  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0146  nucleotidyltransferase family protein  40.38 
 
 		 106 aa  66.6  0.0000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0363177  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0845  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 96 aa  51.6  0.000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.406591  normal  0.358781 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0867  DNA polymerase beta domain protein region  35.64 
 
 		 96 aa  50.8  0.000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0506  DNA polymerase beta subunit  35.64 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0241  DNA polymerase beta subunit  39.02 
 
 		 99 aa  50.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0626  DNA polymerase beta subunit  39.19 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.717752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0547  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 100 aa  47.8  0.00005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.790238  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  33.65 
 
 		 94 aa  47.8  0.00006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  35.29 
 
 		 100 aa  47  0.00008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0053  DNA polymerase beta subunit  37.84 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0582464  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0548  DNA polymerase beta domain protein region  30.19 
 
 		 102 aa  46.6  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5818  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 96 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3039  DNA polymerase beta domain protein region  35.58 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1075  DNA polymerase beta domain protein region  31.37 
 
 		 97 aa  45.4  0.0003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.796392  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1851  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1877  DNA polymerase beta domain protein region  30.39 
 
 		 96 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0157  DNA polymerase beta domain protein region  33.72 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2714  DNA polymerase, beta-like region  35.53 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.505964  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0444  nucleotidyltransferase  43.55 
 
 		 98 aa  44.3  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.190147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3786  DNA polymerase beta domain protein region  31.17 
 
 		 97 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.123289  normal  0.700807 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0949  DNA polymerase beta subunit  36.63 
 
 		 102 aa  43.9  0.0008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.878884  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0854  DNA polymerase beta subunit  32.43 
 
 		 96 aa  42.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  32.53 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1178  DNA polymerase beta subunit  29.07 
 
 		 98 aa  41.6  0.003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.448012  normal  0.179286 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0844  DNA polymerase beta subunit  31.51 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.909458  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1806  DNA polymerase beta domain protein region  36.92 
 
 		 104 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.943156  normal  0.843762 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1164  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1188  DNA polymerase beta domain protein region  31.46 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3457  DNA polymerase beta subunit  32.79 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0288007 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0548  nucleotidyltransferase family protein  26 
 
 		 93 aa  40.8  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2366  DNA polymerase beta subunit  37.7 
 
 		 115 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.878119  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0015  hypothetical protein  31.71 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2422  DNA polymerase, beta-like region  32.71 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>