16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2185 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2185  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  222  2e-57  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.141631  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2192  DNA polymerase, beta-like region  96 
 
 		 110 aa  144  4.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.479342  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6474  DNA polymerase beta domain protein region  66.22 
 
 		 102 aa  98.6  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0900  DNA polymerase beta subunit  45.07 
 
 		 103 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2453  DNA polymerase beta subunit  46.88 
 
 		 100 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00090311  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0898  DNA polymerase, beta-like region  41.67 
 
 		 103 aa  43.5  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0274  DNA polymerase beta subunit  29.41 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.122937  unclonable  0.00000800451 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0088  DNA polymerase beta subunit  47.46 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0340868 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1228  DNA polymerase beta subunit  37.31 
 
 		 97 aa  42.4  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  43.28 
 
 		 99 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0998  DNA polymerase beta domain protein region  50 
 
 		 102 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.050559 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3299  DNA polymerase beta domain protein region  31.82 
 
 		 96 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000315403 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  46.3 
 
 		 96 aa  41.6  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1162  DNA polymerase beta subunit  43.08 
 
 		 100 aa  42  0.003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1762  nucleotidyltransferase family protein  43.66 
 
 		 97 aa  41.2  0.005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.324196 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1968  nucleotidyltransferase  34.67 
 
 		 99 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>