23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3517 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 126 aa  254  3e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0600  hypothetical protein  67 
 
 		 203 aa  133  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  37.17 
 
 		 119 aa  75.9  0.0000000000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  35.4 
 
 		 119 aa  73.2  0.000000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  35.51 
 
 		 121 aa  58.5  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  33.64 
 
 		 133 aa  57  0.00000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  40 
 
 		 265 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  38.75 
 
 		 115 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  43.75 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  34.74 
 
 		 124 aa  48.9  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  32.56 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  34.02 
 
 		 120 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0028  nucleotidyltransferase family protein  41.1 
 
 		 96 aa  43.1  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.422617  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0871  DNA polymerase beta domain protein region  34.12 
 
 		 99 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1438  DNA polymerase beta subunit  31 
 
 		 129 aa  41.6  0.004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000000026658  hitchhiker  0.0000058254 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1789  DNA polymerase beta domain protein region  35.37 
 
 		 109 aa  40.8  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  34.57 
 
 		 102 aa  40.4  0.008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  32.39 
 
 		 127 aa  40  0.01  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  30.11 
 
 		 110 aa  40  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>