16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0518 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  100 
 
 
110 aa  223  7e-58  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  44.58 
 
 
114 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  43.75 
 
 
125 aa  68.2  0.00000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  37.76 
 
 
119 aa  60.1  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  47.62 
 
 
265 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  44.78 
 
 
115 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  35.71 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  41.43 
 
 
113 aa  49.7  0.00001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  42.37 
 
 
127 aa  48.1  0.00004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 
119 aa  47.8  0.00005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  45.28 
 
 
148 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  45.28 
 
 
148 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  36.36 
 
 
124 aa  44.7  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  31.25 
 
 
121 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  30.11 
 
 
126 aa  40  0.01  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>