20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TRQ2_0280 on replicon NC_010483
Organism: Thermotoga sp. RQ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 		 119 aa  230  6e-60  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  89.92 
 
 		 119 aa  213  9.999999999999999e-55  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  35.4 
 
 		 126 aa  77.8  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  42.71 
 
 		 127 aa  76.6  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0600  hypothetical protein  37 
 
 		 203 aa  68.6  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  39 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  39 
 
 		 133 aa  68.2  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  35.92 
 
 		 124 aa  60.8  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  37.5 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  35.71 
 
 		 110 aa  58.2  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  37 
 
 		 265 aa  56.6  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  33.33 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  37.5 
 
 		 120 aa  56.2  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  31.13 
 
 		 114 aa  53.1  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  32.63 
 
 		 121 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  33.72 
 
 		 148 aa  51.2  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  32.11 
 
 		 124 aa  50.8  0.000007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  30.7 
 
 		 125 aa  50.4  0.000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  33.72 
 
 		 148 aa  49.3  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3173  DNA polymerase beta subunit  26.42 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>