16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2407 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 		 124 aa  251  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  59.68 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  59.68 
 
 		 133 aa  159  9e-39  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  45.26 
 
 		 121 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  36.73 
 
 		 127 aa  71.6  0.000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  37.25 
 
 		 119 aa  67.8  0.00000000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  37.11 
 
 		 265 aa  67.4  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  35.05 
 
 		 115 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  33.33 
 
 		 126 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  36.08 
 
 		 119 aa  57.8  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  45.35 
 
 		 113 aa  57  0.00000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  35.63 
 
 		 148 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  36.47 
 
 		 148 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 		 120 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  36.36 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  32.04 
 
 		 114 aa  40.4  0.008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>