21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2754 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  236  5e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  69.91 
 
 
265 aa  168  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  46.85 
 
 
148 aa  103  7e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  48.15 
 
 
148 aa  102  1e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  41.24 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  39.58 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  35.05 
 
 
124 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  33.71 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  44.78 
 
 
110 aa  60.1  0.000000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  37.5 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  29.9 
 
 
121 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  38.75 
 
 
126 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  34.48 
 
 
113 aa  51.2  0.000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  40.98 
 
 
125 aa  49.7  0.00002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0862  DNA polymerase beta domain protein region  31.18 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000634599  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1691  DNA polymerase beta domain protein region  30 
 
 
101 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  29.7 
 
 
114 aa  45.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  37.65 
 
 
124 aa  42  0.003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0369  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 
105 aa  41.2  0.005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.832865  normal  0.194305 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0332  DNA polymerase beta domain protein region  39.44 
 
 
94 aa  40.4  0.009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>