12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Teth514_2250 on replicon NC_010320
Organism: Thermoanaerobacter sp. X514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010320  Teth514_2250  DNA polymerase beta subunit  100 
 
 
125 aa  245  1e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000010883  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  39.81 
 
 
114 aa  76.3  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0518  hypothetical protein  43.75 
 
 
110 aa  68.2  0.00000000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.00471215  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  30.7 
 
 
119 aa  53.1  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  32.63 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2754  hypothetical protein  40.98 
 
 
115 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.604602  hitchhiker  0.000634444 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  29.17 
 
 
127 aa  44.7  0.0005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3358  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  43.5  0.0009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3173  DNA polymerase beta subunit  27.42 
 
 
123 aa  41.2  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4369  hypothetical protein  27.91 
 
 
148 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955816 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  28.57 
 
 
119 aa  40.8  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4308  hypothetical protein  31.34 
 
 
148 aa  40.8  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>