13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2315 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2315  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
120 aa  241  1.9999999999999999e-63  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000759892  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1646  DNA polymerase beta domain protein region  38.2 
 
 
113 aa  60.5  0.000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0702167  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0282  DNA polymerase beta subunit  36.67 
 
 
119 aa  57.4  0.00000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2319  DNA polymerase, beta-like region  39.81 
 
 
114 aa  57  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000830496  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0280  DNA polymerase beta subunit  38.95 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000175333  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2407  DNA polymerase beta domain protein region  44.44 
 
 
124 aa  47.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0502  DNA polymerase beta domain protein region  32.17 
 
 
124 aa  46.6  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3517  DNA polymerase beta subunit  34.02 
 
 
126 aa  43.5  0.001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.53716  normal  0.909261 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0600  hypothetical protein  34.15 
 
 
203 aa  42.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.887061 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2832  DNA polymerase beta domain protein region  36.28 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3265  DNA polymerase beta domain protein region  36.28 
 
 
133 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.165533  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0416  hypothetical protein  32.97 
 
 
127 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0566147 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0175  DNA polymerase beta subunit  38.37 
 
 
121 aa  41.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.193689 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>