12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_1950 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_1950  DNA polymerase beta domain protein region  100 
 
 
158 aa  303  6e-82  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0129  DNA polymerase beta domain protein region  32.24 
 
 
147 aa  49.7  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00283824  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0769  DNA polymerase beta subunit  35.63 
 
 
140 aa  48.5  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.452444 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2165  DNA polymerase beta subunit  26.67 
 
 
151 aa  46.2  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0225  DNA polymerase beta domain protein region  30.85 
 
 
142 aa  45.1  0.0004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0364  DNA polymerase beta subunit  32.5 
 
 
148 aa  44.3  0.0007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2757  nucleotidyltransferase family protein  26.04 
 
 
102 aa  42.7  0.002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2973  DNA polymerase beta subunit  40 
 
 
132 aa  42  0.003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2244  DNA polymerase beta subunit  23.71 
 
 
146 aa  42  0.003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.521292  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1668  DNA polymerase beta domain protein region  32.22 
 
 
146 aa  42.4  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1223  DNA polymerase beta domain protein region  32.23 
 
 
143 aa  42  0.003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3253  DNA polymerase beta domain protein region  45.95 
 
 
132 aa  40.4  0.009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>