64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3653 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  270  4.0000000000000004e-72  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  83.7 
 
 		 135 aa  228  2e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2107  hypothetical protein  40.6 
 
 		 138 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0461455  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  35.48 
 
 		 139 aa  67.8  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.47 
 
 		 140 aa  66.6  0.0000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  30.43 
 
 		 142 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  63.5  0.0000000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  31.58 
 
 		 147 aa  62.4  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  26.02 
 
 		 130 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  32.03 
 
 		 144 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  32.56 
 
 		 135 aa  62  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  29.47 
 
 		 141 aa  60.8  0.000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  29.77 
 
 		 137 aa  57.8  0.00000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  34.88 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  42.65 
 
 		 144 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  32.74 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  30.23 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  33.7 
 
 		 149 aa  56.6  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  29.32 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  41.94 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  27.48 
 
 		 133 aa  54.3  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  23.02 
 
 		 146 aa  54.3  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  39.06 
 
 		 141 aa  53.9  0.0000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  37.7 
 
 		 138 aa  53.1  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  36.07 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  36.05 
 
 		 292 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  31.25 
 
 		 139 aa  52.8  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  39.08 
 
 		 143 aa  52  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  30.89 
 
 		 128 aa  51.6  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  33.63 
 
 		 131 aa  50.8  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  33.8 
 
 		 138 aa  50.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  30.33 
 
 		 146 aa  50.1  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.94 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  35 
 
 		 140 aa  48.9  0.00002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  31.25 
 
 		 136 aa  48.9  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  31.48 
 
 		 143 aa  48.9  0.00003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  32.09 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  39.13 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  32.5 
 
 		 137 aa  47  0.00008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  28.68 
 
 		 139 aa  46.2  0.0001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  40.54 
 
 		 271 aa  46.6  0.0001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  31.71 
 
 		 139 aa  46.6  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  26.21 
 
 		 144 aa  46.2  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  38.81 
 
 		 142 aa  46.2  0.0002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  33.59 
 
 		 142 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  27.48 
 
 		 142 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  34.88 
 
 		 141 aa  45.1  0.0003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  30.36 
 
 		 276 aa  44.3  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  30.99 
 
 		 143 aa  43.9  0.0007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  28.45 
 
 		 138 aa  43.1  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  25.27 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  33.71 
 
 		 142 aa  43.1  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  30.08 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  27.07 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0946  hypothetical protein  24 
 
 		 144 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  27.2 
 
 		 137 aa  42  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0927  hypothetical protein  24 
 
 		 144 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.472953  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1440  hypothetical protein  31.67 
 
 		 252 aa  42  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1719  hypothetical protein  25.51 
 
 		 291 aa  41.2  0.004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.304026  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  29.55 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  34.88 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1900  hypothetical protein  35 
 
 		 250 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  30.09 
 
 		 295 aa  40  0.01  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>