57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1317 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  100 
 
 		 138 aa  279  8.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  27.82 
 
 		 146 aa  70.9  0.000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  28.23 
 
 		 130 aa  67.8  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  30.37 
 
 		 144 aa  67  0.00000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  33.33 
 
 		 142 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  29.52 
 
 		 149 aa  63.5  0.0000000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  30.95 
 
 		 139 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.24 
 
 		 140 aa  62  0.000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  35.35 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  27.68 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  24.41 
 
 		 139 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  25.93 
 
 		 139 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  32.35 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  26.4 
 
 		 137 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  33.01 
 
 		 112 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  31.43 
 
 		 141 aa  56.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  32.53 
 
 		 147 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  31.25 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  41.38 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  31.11 
 
 		 137 aa  55.1  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  25.2 
 
 		 137 aa  53.9  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  27.34 
 
 		 143 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  29.11 
 
 		 135 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  23.2 
 
 		 133 aa  52.8  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0216  hypothetical protein  24.37 
 
 		 141 aa  52  0.000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  33.8 
 
 		 137 aa  50.4  0.000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  37.65 
 
 		 139 aa  50.1  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  28.46 
 
 		 141 aa  49.7  0.00001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 		 149 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  27.38 
 
 		 140 aa  48.5  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  27.16 
 
 		 138 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  29.27 
 
 		 144 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  36.62 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  30.95 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  26.15 
 
 		 136 aa  48.1  0.00004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  23.26 
 
 		 140 aa  47.4  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  29.82 
 
 		 141 aa  47  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  24.24 
 
 		 292 aa  47  0.00008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  27.06 
 
 		 136 aa  47.4  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  29.33 
 
 		 139 aa  46.2  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  23.85 
 
 		 137 aa  45.8  0.0002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  24.24 
 
 		 139 aa  45.1  0.0003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  28.83 
 
 		 132 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  25.74 
 
 		 140 aa  44.3  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  22.89 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  22.89 
 
 		 139 aa  43.9  0.0007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 		 85 aa  43.5  0.0009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  23.02 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  26.32 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  26.79 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  25.41 
 
 		 271 aa  41.2  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  26.58 
 
 		 142 aa  41.2  0.004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  26.83 
 
 		 146 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1762  hypothetical protein  30.67 
 
 		 276 aa  40.8  0.006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.254099  normal  0.270022 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  31.58 
 
 		 141 aa  40.4  0.008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  28.38 
 
 		 140 aa  40.4  0.008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  38.64 
 
 		 142 aa  40  0.01  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>