63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4529 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  100 
 
 
132 aa  266  5.9999999999999995e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  65.65 
 
 
131 aa  180  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0527  protein of unknown function DUF86  30.95 
 
 
133 aa  80.9  0.000000000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
139 aa  77  0.00000000000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  38.1 
 
 
139 aa  75.5  0.0000000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  30.83 
 
 
146 aa  74.7  0.0000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  33.9 
 
 
140 aa  67.8  0.00000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  32.77 
 
 
135 aa  67.4  0.00000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  30.4 
 
 
147 aa  66.6  0.0000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  29.6 
 
 
138 aa  65.1  0.0000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  30.71 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  30.4 
 
 
137 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  32.03 
 
 
128 aa  63.2  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  29.73 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  29.69 
 
 
145 aa  61.2  0.000000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2562  protein of unknown function DUF86  26.77 
 
 
138 aa  60.5  0.000000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  30.71 
 
 
144 aa  60.1  0.00000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  29.37 
 
 
139 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  29.6 
 
 
137 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  28.91 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  28.91 
 
 
139 aa  58.5  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  31.4 
 
 
143 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  31.4 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  28.46 
 
 
130 aa  57.8  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  29.92 
 
 
140 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  32.97 
 
 
140 aa  57.4  0.00000007  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  28.35 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  30.23 
 
 
136 aa  57  0.00000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  30 
 
 
143 aa  56.6  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  31.58 
 
 
149 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  30.89 
 
 
139 aa  55.5  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  34.65 
 
 
140 aa  54.7  0.0000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  27.97 
 
 
142 aa  54.7  0.0000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  35.2 
 
 
138 aa  55.1  0.0000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  31.63 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  27.05 
 
 
144 aa  53.5  0.0000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.07 
 
 
141 aa  53.1  0.000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  29.37 
 
 
142 aa  53.1  0.000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  29.46 
 
 
271 aa  52.8  0.000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  32.28 
 
 
151 aa  52.4  0.000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  34.09 
 
 
112 aa  50.8  0.000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  32.14 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  27.43 
 
 
133 aa  49.7  0.00001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  29.29 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  32.2 
 
 
146 aa  48.9  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  31.76 
 
 
143 aa  49.3  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  28.83 
 
 
142 aa  48.1  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  28.16 
 
 
139 aa  48.1  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  40.58 
 
 
149 aa  47  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  37.88 
 
 
85 aa  46.6  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  27.61 
 
 
292 aa  45.8  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  33.63 
 
 
105 aa  46.2  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  32.58 
 
 
144 aa  45.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  28.83 
 
 
138 aa  45.4  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.05 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  25.89 
 
 
140 aa  45.4  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  26.97 
 
 
140 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1026  hypothetical protein  32 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.304119  normal  0.375352 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0429  hypothetical protein  24.36 
 
 
141 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0671683  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  28.57 
 
 
143 aa  40.8  0.006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0393  hypothetical protein  26.67 
 
 
142 aa  40.8  0.007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.109457  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1103  hypothetical protein  32.69 
 
 
139 aa  40.4  0.008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.320757 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1311  hypothetical protein  30 
 
 
141 aa  40  0.01  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>