67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_2333 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  274  4e-73  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  58.65 
 
 		 139 aa  172  9.999999999999999e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  57.89 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  57.89 
 
 		 139 aa  170  5.999999999999999e-42  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  59.09 
 
 		 138 aa  169  1e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  58.21 
 
 		 136 aa  157  5e-38  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  57.58 
 
 		 137 aa  151  2.9999999999999998e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  45.61 
 
 		 140 aa  98.2  3e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  40.17 
 
 		 139 aa  96.7  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  33.85 
 
 		 135 aa  91.7  3e-18  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1275  hypothetical protein  37.6 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000365533 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  38.02 
 
 		 140 aa  89.7  1e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  37.1 
 
 		 146 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  34.85 
 
 		 147 aa  89  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  33.33 
 
 		 137 aa  87  8e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  31.45 
 
 		 133 aa  87  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  35.16 
 
 		 142 aa  86.7  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  36.15 
 
 		 144 aa  80.9  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  37.1 
 
 		 139 aa  80.1  0.000000000000009  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  34.38 
 
 		 143 aa  80.1  0.00000000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  32.81 
 
 		 140 aa  78.6  0.00000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  32.12 
 
 		 140 aa  72  0.000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  32.35 
 
 		 140 aa  71.6  0.000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  30.15 
 
 		 139 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  29.55 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1671  protein of unknown function DUF86  26.19 
 
 		 139 aa  70.1  0.000000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0179  hypothetical protein  33.06 
 
 		 128 aa  68.2  0.00000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00352921  normal  0.908992 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1945  hypothetical protein  34.75 
 
 		 131 aa  67.8  0.00000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.755475  normal  0.160304 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  30.3 
 
 		 140 aa  64.7  0.0000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  29.55 
 
 		 137 aa  62.4  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  30.43 
 
 		 130 aa  61.2  0.000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  34.04 
 
 		 146 aa  60.8  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2972  hypothetical protein  55.81 
 
 		 46 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  31.76 
 
 		 140 aa  59.3  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1251  protein of unknown function DUF86  27.94 
 
 		 141 aa  58.5  0.00000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.414648 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  27.91 
 
 		 141 aa  57.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4529  hypothetical protein  30.23 
 
 		 132 aa  57  0.00000008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.249791  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  29.37 
 
 		 137 aa  55.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  30.16 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  31.46 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  31.88 
 
 		 142 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  31.87 
 
 		 139 aa  52.4  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1679  hypothetical protein  32.97 
 
 		 143 aa  52.8  0.000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000033772  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  40 
 
 		 85 aa  50.4  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1589  hypothetical protein  31.82 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  29.01 
 
 		 138 aa  49.7  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  32.58 
 
 		 135 aa  48.1  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1769  hypothetical protein  29.82 
 
 		 292 aa  47.8  0.00005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.026632  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1317  hypothetical protein  27.06 
 
 		 138 aa  47.4  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0073  hypothetical protein  28.57 
 
 		 112 aa  47.4  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.483504  normal  0.176783 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1224  protein of unknown function DUF86  25.95 
 
 		 142 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  25.58 
 
 		 143 aa  44.7  0.0004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  26.85 
 
 		 149 aa  44.7  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1106  hypothetical protein  30.93 
 
 		 144 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00999093  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3045  hypothetical protein  25.76 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.161016  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0210  hypothetical protein  28.57 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.281123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2164  hypothetical protein  22.73 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0546  protein of unknown function DUF86  25.81 
 
 		 151 aa  42.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000598911  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1884  hypothetical protein  51.43 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.234797 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  23.96 
 
 		 149 aa  42  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  23.58 
 
 		 143 aa  41.2  0.004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2316  hypothetical protein  26.36 
 
 		 105 aa  41.6  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0239991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0761  hypothetical protein  28.79 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0131457  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0186  hypothetical protein  22.66 
 
 		 149 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.894445 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3653  hypothetical protein  29.55 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.352214  normal  0.739112 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1369  hypothetical protein  43.18 
 
 		 123 aa  40.8  0.007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.150444  normal  0.253004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1792  hypothetical protein  29.03 
 
 		 295 aa  40.4  0.009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.210053 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>