44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0544 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0544  hypothetical protein  100 
 
 
145 aa  297  3e-80  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00745715  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1403  hypothetical protein  42.66 
 
 
149 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0680673  normal  0.202766 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0270  hypothetical protein  31.86 
 
 
147 aa  64.7  0.0000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1047  hypothetical protein  29.37 
 
 
140 aa  63.9  0.0000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.68941  normal  0.087721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0767  hypothetical protein  31.54 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0768  hypothetical protein  31.54 
 
 
139 aa  62.8  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1470  protein of unknown function DUF86  30 
 
 
139 aa  59.7  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.35466  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0224  protein of unknown function DUF86  27.78 
 
 
130 aa  59.3  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2344  protein of unknown function DUF86  30.23 
 
 
140 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5680  hypothetical protein  30.36 
 
 
137 aa  59.3  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684551  hitchhiker  0.00143143 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0128  protein of unknown function DUF86  34.07 
 
 
140 aa  58.5  0.00000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.00082454  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1588  protein of unknown function DUF86  29.92 
 
 
138 aa  57.8  0.00000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.181939  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2423  hypothetical protein  30.77 
 
 
135 aa  57  0.00000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3258  hypothetical protein  33.71 
 
 
139 aa  54.7  0.0000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0115451  hitchhiker  2.57897e-16 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2333  hypothetical protein  30.16 
 
 
136 aa  54.7  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1971  protein of unknown function DUF86  29.13 
 
 
136 aa  53.9  0.0000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.190961 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2243  hypothetical protein  28.57 
 
 
146 aa  52.4  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.125397  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0134  hypothetical protein  32.65 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3166  hypothetical protein  25.25 
 
 
133 aa  50.8  0.000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2947  hypothetical protein  30.61 
 
 
140 aa  50.4  0.000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1074  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.673636  normal  0.243145 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0363  hypothetical protein  32.03 
 
 
139 aa  49.7  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4417  hypothetical protein  27.61 
 
 
137 aa  49.3  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.126362 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0659  hypothetical protein  33.33 
 
 
140 aa  49.3  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000879573  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0245  protein of unknown function DUF86  29.9 
 
 
141 aa  48.5  0.00003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1815  hypothetical protein  27.13 
 
 
137 aa  48.1  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0000107502  normal  0.591641 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0762  hypothetical protein  26.72 
 
 
137 aa  47.4  0.00007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.120748 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1862  hypothetical protein  26.61 
 
 
139 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3254  protein of unknown function DUF86  27 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0770  hypothetical protein  27.88 
 
 
143 aa  45.4  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.465688 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2568  protein of unknown function DUF86  28.41 
 
 
140 aa  45.8  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1396  protein of unknown function DUF86  25.71 
 
 
144 aa  45.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0026346  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0319  hypothetical protein  32.47 
 
 
142 aa  44.7  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2953  hypothetical protein  29.67 
 
 
146 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3016  hypothetical protein  28.24 
 
 
131 aa  43.9  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1951  protein of unknown function DUF86  27.72 
 
 
149 aa  43.5  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1667  protein of unknown function DUF86  24.41 
 
 
139 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2194  protein of unknown function DUF86  28 
 
 
143 aa  42  0.003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000224954  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2733  protein of unknown function DUF86  33.33 
 
 
138 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.226128  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0894  hypothetical protein  29.69 
 
 
139 aa  42  0.003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2977  protein of unknown function DUF86  28.07 
 
 
140 aa  41.6  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4098  hypothetical protein  27.55 
 
 
135 aa  41.6  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.272071  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2629  protein of unknown function DUF86  30.77 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.436875  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1736  hypothetical protein  32 
 
 
271 aa  40.4  0.007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.76389  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>