More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_3080 on replicon NC_009939
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009939  Dgeo_3080  helicase related protein  100 
 
 		 1786 aa  3601    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08850  helicase domain protein  25.42 
 
 		 467 aa  95.9  6e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000230967  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1801  SNF2-related protein  25.74 
 
 		 572 aa  77  0.000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0724538  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40372  predicted protein  25.07 
 
 		 663 aa  74.7  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008147  Mmcs_5493  helicase-like protein  38.39 
 
 		 1069 aa  73.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  normal  0.0695829 
 
 
-
 
NC_008704  Mkms_5893  helicase domain-containing protein  38.39 
 
 		 1069 aa  73.6  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0213  SNF2-related protein  24.79 
 
 		 554 aa  73.2  0.00000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0387  helicase domain protein  24.51 
 
 		 584 aa  71.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0811  helicase-like protein  35.38 
 
 		 1201 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4785  helicase domain-containing protein  34.85 
 
 		 724 aa  70.9  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0599344  normal  0.582969 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0827  helicase domain-containing protein  35.38 
 
 		 1201 aa  70.9  0.0000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0251  helicase  22.58 
 
 		 541 aa  70.1  0.0000000003  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.432976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2498  helicase domain protein  36.51 
 
 		 774 aa  70.5  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3320  SNF2 family helicase  24.08 
 
 		 951 aa  69.3  0.0000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0640  helicase-like  38.05 
 
 		 972 aa  69.3  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.060382 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2545  helicase domain protein  42.11 
 
 		 1038 aa  68.9  0.0000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0721063  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0063  Type III restriction enzyme, res subunit  36.36 
 
 		 962 aa  68.9  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4359  putative helicase  22.68 
 
 		 560 aa  68.9  0.0000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2729  helicase-like  36.04 
 
 		 1165 aa  68.9  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.36993  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3304  non-specific serine/threonine protein kinase  23.42 
 
 		 1002 aa  68.9  0.0000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0728777  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4132  helicase  22.68 
 
 		 560 aa  68.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3972  SNF2 family helicase  22.68 
 
 		 560 aa  68.6  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3982  SNF2 family helicase  22.68 
 
 		 560 aa  68.6  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4450  helicase  22.68 
 
 		 560 aa  68.6  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.982586  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4340  putative helicase  23.14 
 
 		 560 aa  68.2  0.000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.486196  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4248  putative helicase  23.18 
 
 		 560 aa  67.8  0.000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2362  SNF2-related protein  21.74 
 
 		 555 aa  68.2  0.000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4083  non-specific serine/threonine protein kinase  22.37 
 
 		 560 aa  67.4  0.000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0176  SNF2-related protein  24.58 
 
 		 777 aa  67.8  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3559  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 941 aa  66.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.895393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1176  helicase domain-containing protein  30.43 
 
 		 941 aa  66.2  0.000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2198  helicase domain-containing protein  28.64 
 
 		 1046 aa  65.9  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.33194  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3508  ATP-dependent helicase HepA  24.6 
 
 		 968 aa  65.5  0.000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.285717  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0240  helicase domain-containing protein  31.25 
 
 		 1116 aa  65.5  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956133  hitchhiker  0.00192271 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1609  helicase domain-containing protein  32.69 
 
 		 1129 aa  65.5  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0081  SNF2 family helicase  23.06 
 
 		 1181 aa  64.3  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3005  DEAD-box ATP dependent DNA helicase  32.85 
 
 		 1212 aa  64.3  0.00000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2099  helicase domain protein  33.85 
 
 		 1194 aa  64.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0625  ATP-dependent helicase HepA  23.16 
 
 		 968 aa  63.9  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1234  helicase domain protein  34.38 
 
 		 1170 aa  64.3  0.00000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0795356  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2718  helicase domain-containing protein  34.35 
 
 		 1170 aa  63.9  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00349209 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1123  helicase domain protein  30.81 
 
 		 1169 aa  63.2  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0202  helicase domain protein  30.81 
 
 		 1170 aa  63.2  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0567319 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0633  helicase domain-containing protein  30.81 
 
 		 1169 aa  63.2  0.00000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1416  helicase domain protein  23.42 
 
 		 945 aa  63.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1846  helicase domain-containing protein  36.43 
 
 		 1170 aa  63.5  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0900  putative helicase  22.39 
 
 		 560 aa  63.2  0.00000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0637  helicase domain protein  34.92 
 
 		 1168 aa  62.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1407  DEAD/DEAH box helicase-like  29.85 
 
 		 624 aa  62.8  0.00000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.721389  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3677  helicase, C-terminal:dead/deah box helicase, n-terminal  27.56 
 
 		 1043 aa  62.4  0.00000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03699  ATP-dependent helicase HepA  24.35 
 
 		 947 aa  62.4  0.00000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3352  hypothetical protein  31.51 
 
 		 919 aa  62.8  0.00000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.14559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0680  helicase domain-containing protein  32.61 
 
 		 1167 aa  62.4  0.00000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.272356 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05643  SNF2 family helicase/ATPase, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G13460)  21.27 
 
 		 1111 aa  62.4  0.00000008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4306  helicase, putative  22.16 
 
 		 560 aa  62.4  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1492  helicase domain protein  33.64 
 
 		 969 aa  62.4  0.00000008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3539  SNF2-related protein  20.42 
 
 		 872 aa  62  0.00000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3846  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1058 aa  62  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.064852 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0816  helicase domain-containing protein  28.97 
 
 		 933 aa  62  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0970467  normal  0.111384 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1123  helicase domain protein  37.63 
 
 		 966 aa  62  0.0000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0214668  normal  0.0288722 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2916  SNF2-related protein  22.07 
 
 		 560 aa  61.6  0.0000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2726  helicase domain protein  36.61 
 
 		 1057 aa  62  0.0000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.48932 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2916  non-specific serine/threonine protein kinase  24.23 
 
 		 1449 aa  62  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1177  helicase domain-containing protein  27.78 
 
 		 1031 aa  60.8  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.304258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3277  SNF2-related helicase  24.52 
 
 		 1078 aa  60.8  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.65326 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0196  helicase domain-containing protein  33.33 
 
 		 1167 aa  60.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.037499  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1648  DEAD/DEAH box helicase-like  30 
 
 		 607 aa  60.8  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1019  helicase domain protein  31.78 
 
 		 1160 aa  60.8  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.180274  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2324  helicase domain protein  30.77 
 
 		 1095 aa  61.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1072  SNF2-like protein  24.42 
 
 		 1072 aa  60.5  0.0000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2766  helicase domain-containing protein  32.58 
 
 		 906 aa  60.1  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.388883  hitchhiker  0.00506204 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0610  type III restriction protein res subunit  26.28 
 
 		 905 aa  60.5  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1355  helicase domain-containing protein  25.75 
 
 		 954 aa  60.5  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1877  helicase domain-containing protein  31.82 
 
 		 1172 aa  60.5  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.464999  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5359  helicase domain protein  31.86 
 
 		 1049 aa  60.1  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.111464 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18000  DEAD box and SNF-like helicase domain-containing protein  23.66 
 
 		 1357 aa  60.1  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.153374  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1920  helicase domain protein  26.47 
 
 		 971 aa  60.1  0.0000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0457  ATP-dependent helicase HepA  23.65 
 
 		 968 aa  59.7  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.65643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0656  DEAD/DEAH family helicase  28.65 
 
 		 760 aa  59.7  0.0000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0288  helicase domain protein  28.91 
 
 		 1037 aa  59.7  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4324  ATP-dependent helicase HepA  22.83 
 
 		 968 aa  59.7  0.0000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2524  SNF2-related helicase-like  33.64 
 
 		 915 aa  59.7  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.180515  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_231  predicted protein  24.19 
 
 		 970 aa  59.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0373  SNF2-related protein  23.16 
 
 		 1159 aa  59.7  0.0000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_28551  imitation switch isoform 1, alias nucleosome remodeling factor 140 kDa subunit  22.82 
 
 		 1023 aa  59.7  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0148713  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1301  helicase domain protein  31.25 
 
 		 1062 aa  59.7  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.483393  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2756  helicase domain protein  23.1 
 
 		 584 aa  59.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0464  helicase domain protein  31.21 
 
 		 1044 aa  59.3  0.0000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011774  BCG9842_A0072  RecQ helicase, putative  38.82 
 
 		 468 aa  59.3  0.0000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2988  helicase domain-containing protein  34.11 
 
 		 1167 aa  58.9  0.0000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.249556  normal  0.0303963 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4828  helicase family protein  26.32 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1271  helicase domain-containing protein  29.87 
 
 		 1177 aa  58.9  0.0000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5808  helicase family protein  26.32 
 
 		 952 aa  58.9  0.0000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4171  helicase domain-containing protein  23.54 
 
 		 947 aa  58.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4903  type III restriction enzyme, res subunit  22.59 
 
 		 963 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.891445  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4894  helicase family protein  25.44 
 
 		 952 aa  58.9  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4221  ATP-dependent RNA helicase RhlB  28.21 
 
 		 421 aa  58.5  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0989994  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03240  DNA/RNA helicase, superfamily II, SNF2 family  32.43 
 
 		 1028 aa  58.2  0.000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3885  helicase domain-containing protein  26.32 
 
 		 952 aa  58.2  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.929535  normal  1 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_13093  predicted protein  21.55 
 
 		 495 aa  58.5  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>