28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1276 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1276  hypothetical protein  100 
 
 
315 aa  643    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0854607  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1803  hypothetical protein  83.49 
 
 
315 aa  551  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1768  hypothetical protein  83.49 
 
 
315 aa  551  1e-156  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2709  N-6 DNA methylase  35.6 
 
 
329 aa  199  7e-50  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0488  hypothetical protein  35.29 
 
 
328 aa  198  9e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.682666 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3311  N-6 DNA methylase  34.06 
 
 
329 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.253623  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4372  adenine-specific DNA methyltransferase  35.19 
 
 
330 aa  196  3e-49  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4756  hypothetical protein  35.19 
 
 
328 aa  196  3e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4747  hypothetical protein  34.67 
 
 
328 aa  196  3e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4773  hypothetical protein  34.67 
 
 
328 aa  196  5.000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4774  hypothetical protein  34.57 
 
 
330 aa  196  6e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4469  putative adenine-specific DNA methyltransferase  33.95 
 
 
328 aa  195  7e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4382  adenine-specific DNA methyltransferase  34.57 
 
 
330 aa  195  8.000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4536  hypothetical protein  34.88 
 
 
330 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4889  hypothetical protein  34.88 
 
 
330 aa  193  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0730  N-6 DNA methylase  34.26 
 
 
329 aa  192  8e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0559  adenine-specific DNA methylase-like protein  36.58 
 
 
277 aa  187  2e-46  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1835  hypothetical protein  36.61 
 
 
318 aa  158  9e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000176209  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0468  adenine-specific DNA methylase  30.86 
 
 
329 aa  148  1.0000000000000001e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0167  hypothetical protein  34.78 
 
 
324 aa  145  1e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.37064  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1270  adenine-specific DNA methylase  30.98 
 
 
333 aa  132  5e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.551057  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2296  hypothetical protein  31.84 
 
 
312 aa  132  7.999999999999999e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  25.47 
 
 
1669 aa  61.2  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2546  helicase, C-terminal  23.94 
 
 
1669 aa  54.7  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.26749 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  24.04 
 
 
1642 aa  52.8  0.000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3652  N-6 DNA methylase  26.92 
 
 
489 aa  51.2  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.729594 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  23.4 
 
 
1726 aa  45.1  0.002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0610  restriction modification system DNA specificity subunit  22.06 
 
 
730 aa  42.7  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>