21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_4314 on replicon NC_008242
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008242  Meso_4314  adenine-specific DNA methylase-like protein  100 
 
 
246 aa  501  1e-141  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.1972  n/a   
 
 
-
 
NC_007961  Nham_4656  N-6 DNA methylase  68.48 
 
 
1700 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0264  hypothetical protein  66.67 
 
 
1748 aa  231  8.000000000000001e-60  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9162  helicase SNF2 family  62.96 
 
 
1697 aa  223  3e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4476  helicase-like  60.53 
 
 
1703 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011982  Avi_8079  helicase SNF2 family  63.93 
 
 
470 aa  217  1e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.48311  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4973  helicase domain-containing protein  64.48 
 
 
1697 aa  217  1e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.664795 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4893  DEAD-like helicase  70.65 
 
 
1417 aa  214  9e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9541  helicase SNF2 family  65.03 
 
 
1701 aa  205  6e-52  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.398827  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4742  N-6 DNA methylase  59.68 
 
 
1702 aa  204  7e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6184  helicase domain protein  57.14 
 
 
284 aa  194  1e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0111751 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3732  helicase domain-containing protein  40.56 
 
 
1693 aa  120  1.9999999999999998e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.253895  normal  0.261793 
 
 
-
 
NC_012040  Cla_a002  DNA methylase/helicase  31.58 
 
 
1934 aa  56.2  0.0000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0978124  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3177  helicase domain protein  34.82 
 
 
2077 aa  54.7  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0010  cpp14  30.7 
 
 
1932 aa  53.1  0.000004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0437256  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1280  SNF2 family protein  28.33 
 
 
2274 aa  53.1  0.000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.459246  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1578  helicase domain-containing protein  30.53 
 
 
1642 aa  46.2  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.149983 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4259  helicase domain-containing protein  33.03 
 
 
2570 aa  46.2  0.0005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2221  helicase, C-terminal  28.57 
 
 
1669 aa  44.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.332048 
 
 
-
 
NC_007901  Rfer_4295  helicase-like  27.36 
 
 
1726 aa  43.1  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6722  Methyltransferase type 11  31.3 
 
 
1674 aa  42.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>