25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0947 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0947  protein of unknown function DUF437  100 
 
 
124 aa  253  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1163  hypothetical protein  50.81 
 
 
140 aa  128  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0977787  hitchhiker  0.00188932 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2001  hypothetical protein  44.35 
 
 
140 aa  121  3e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000301137  normal  0.09388 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3659  hypothetical protein  43.9 
 
 
124 aa  117  7e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.114327  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6600  hypothetical protein  45.08 
 
 
124 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000859417  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2297  hypothetical protein  36.36 
 
 
137 aa  98.6  2e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0349  hypothetical protein  37.6 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3584  hypothetical protein  39.2 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1744  hypothetical protein  40 
 
 
161 aa  86.3  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0334105  normal  0.364317 
 
 
-
 
NC_004310  BR0726  Cro/CI family transcriptional regulator  39.84 
 
 
264 aa  85.1  3e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0718  Cro/CI family transcriptional regulator  39.84 
 
 
264 aa  85.1  3e-16  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2706  protein of unknown function DUF437  34.15 
 
 
156 aa  84  6e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000206125  hitchhiker  0.00316318 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2299  hypothetical protein  34.43 
 
 
140 aa  80.5  0.000000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0569  helix-turn-helix domain-containing protein  39.84 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.102394  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5496  hypothetical protein  35.48 
 
 
142 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0466193  normal  0.0701766 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0231  50S ribosomal protein L22/unknown domain fusion protein  31.15 
 
 
311 aa  64.7  0.0000000004  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.415119  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3367  transcriptional regulator  32 
 
 
152 aa  62.8  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0063  hypothetical protein  32.09 
 
 
147 aa  61.6  0.000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.61348  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0147  F0F1 ATP synthase subunit alpha  28.69 
 
 
797 aa  60.8  0.000000006  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.85768  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1083  hypothetical protein  31.67 
 
 
138 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.299063 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1194  hypothetical protein  34.96 
 
 
140 aa  55.1  0.0000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0041  hypothetical protein  32.79 
 
 
141 aa  55.5  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.372109  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1998  hypothetical protein  31.71 
 
 
153 aa  48.5  0.00003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.951524  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0076  hypothetical protein  26.14 
 
 
155 aa  41.6  0.004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1847  hypothetical protein  25 
 
 
142 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>