44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene WD1304 on replicon NC_002978
Organism: Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  100 
 
 
98 aa  194  2.0000000000000003e-49  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0281  hypothetical protein  53.33 
 
 
108 aa  80.1  0.000000000000009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  50.67 
 
 
108 aa  77  0.00000000000007  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0038  hypothetical protein  46.38 
 
 
100 aa  64.3  0.0000000005  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.203606  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  41.33 
 
 
116 aa  63.2  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  43.48 
 
 
115 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  50.88 
 
 
109 aa  60.1  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  49.28 
 
 
91 aa  58.2  0.00000004  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  29.79 
 
 
112 aa  53.9  0.0000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  36.76 
 
 
92 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 
105 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  32.22 
 
 
113 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  40.74 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  40.74 
 
 
96 aa  50.8  0.000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  47.06 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  32.05 
 
 
91 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  31.25 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
107 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  37.5 
 
 
95 aa  47.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  35.82 
 
 
117 aa  47.8  0.00005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  35.29 
 
 
106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  36.92 
 
 
115 aa  45.8  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 
106 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  28.12 
 
 
93 aa  44.3  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  34.85 
 
 
107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  34.85 
 
 
107 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  39.06 
 
 
109 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 
104 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  34.78 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  31.08 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  38 
 
 
94 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 
109 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  34.72 
 
 
109 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  33.85 
 
 
111 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 
112 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 
111 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  35.38 
 
 
102 aa  42  0.003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 
109 aa  41.6  0.003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
93 aa  41.6  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
93 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  37.25 
 
 
94 aa  40.8  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  36.51 
 
 
94 aa  40.8  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  33.33 
 
 
93 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>