55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_3840 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  77.42 
 
 		 93 aa  152  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  148  2e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  146  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  146  1.0000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  72.04 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  70.33 
 
 		 94 aa  142  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  76.74 
 
 		 89 aa  140  7e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 93 aa  124  6e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  64.84 
 
 		 93 aa  123  7e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  63.74 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  63.44 
 
 		 93 aa  121  3e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  56.52 
 
 		 95 aa  117  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  52.81 
 
 		 94 aa  102  1e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  50 
 
 		 96 aa  101  4e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  55.17 
 
 		 95 aa  94.4  4e-19  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  53.01 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  48.81 
 
 		 93 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  49.25 
 
 		 72 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  41.98 
 
 		 92 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  66.67 
 
 		 95 aa  65.5  0.0000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  46.48 
 
 		 94 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 94 aa  63.2  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  36.59 
 
 		 95 aa  56.6  0.0000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  33.33 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  34.94 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  41.54 
 
 		 112 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 107 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  43.08 
 
 		 137 aa  50.1  0.00001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  35.21 
 
 		 106 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 112 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  32.43 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 110 aa  48.5  0.00003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 119 aa  47.8  0.00005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  29.58 
 
 		 111 aa  47.4  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  28.17 
 
 		 113 aa  47  0.00009  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 113 aa  46.2  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  26.97 
 
 		 105 aa  43.5  0.0009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  32.84 
 
 		 113 aa  43.5  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  27.78 
 
 		 111 aa  41.6  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 117 aa  42  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7019  putative transcriptional regulator, XRE family  38.6 
 
 		 109 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0999583 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5345  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 112 aa  41.2  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  27.4 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  39.13 
 
 		 102 aa  40.8  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  33.33 
 
 		 98 aa  40.8  0.007  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  33.33 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>