55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene AFE_1383 on replicon NC_011761
Organism: Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  100 
 
 		 102 aa  202  1e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  65.98 
 
 		 107 aa  131  3e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  71.76 
 
 		 115 aa  129  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  63.16 
 
 		 107 aa  123  7e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  59.18 
 
 		 106 aa  122  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  63.95 
 
 		 91 aa  111  3e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  58.7 
 
 		 109 aa  106  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  56.67 
 
 		 109 aa  100  8e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  55.81 
 
 		 109 aa  98.6  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  43.16 
 
 		 113 aa  97.4  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  46.24 
 
 		 111 aa  93.6  9e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  45.92 
 
 		 115 aa  87.8  5e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  37.63 
 
 		 109 aa  84  7e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  47.67 
 
 		 105 aa  83.6  9e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  81.6  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  45 
 
 		 117 aa  76.3  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  42.27 
 
 		 112 aa  75.1  0.0000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  38.78 
 
 		 111 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 108 aa  70.1  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  44 
 
 		 277 aa  66.6  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  40 
 
 		 112 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  34 
 
 		 109 aa  65.1  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  39.33 
 
 		 112 aa  64.3  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 106 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  32.63 
 
 		 114 aa  63.9  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  38.14 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6342  XRE family transcriptional regulator  44.87 
 
 		 86 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.112314  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3466  XRE family transcriptional regulator  41.77 
 
 		 90 aa  55.8  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  34.94 
 
 		 94 aa  54.3  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  32.5 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  37.88 
 
 		 94 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  36.36 
 
 		 96 aa  50.4  0.000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  35.82 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  28.28 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  28.28 
 
 		 113 aa  47.4  0.00007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  33.8 
 
 		 92 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  30.95 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  31.25 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  32.39 
 
 		 95 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  44.68 
 
 		 93 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  40.62 
 
 		 91 aa  44.3  0.0006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  42.55 
 
 		 89 aa  43.1  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  25.51 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  35.38 
 
 		 98 aa  42  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  28.36 
 
 		 110 aa  42  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  26.51 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  30.86 
 
 		 100 aa  41.2  0.005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  30.88 
 
 		 93 aa  41.2  0.005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  39.13 
 
 		 93 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0795  hypothetical protein  34.72 
 
 		 108 aa  40.4  0.008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29.89 
 
 		 119 aa  40  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  38.3 
 
 		 93 aa  40  0.01  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>