47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_0766 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0766  transcriptional regulator, XRE family  100 
 
 		 111 aa  222  1e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.135908  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  89.62 
 
 		 112 aa  193  5.000000000000001e-49  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  61 
 
 		 112 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  43.93 
 
 		 109 aa  91.7  3e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  42.42 
 
 		 106 aa  84.7  3e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6394  XRE family transcriptional regulator  45.54 
 
 		 112 aa  83.6  9e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  45.26 
 
 		 113 aa  80.9  0.000000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  41.84 
 
 		 115 aa  78.2  0.00000000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3340  Fis family transcriptional regulator  43.02 
 
 		 115 aa  77  0.00000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0220976  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  44.57 
 
 		 111 aa  77  0.00000000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2858  XRE family transcriptional regulator  41.05 
 
 		 111 aa  75.1  0.0000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.699702  normal  1 
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2804  XRE family transcriptional regulator  44.83 
 
 		 117 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4350  transcriptional regulator  43.93 
 
 		 116 aa  73.6  0.0000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.149583  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2380  XRE family transcriptional regulator  38.38 
 
 		 107 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1883  XRE family transcriptional regulator  40.22 
 
 		 109 aa  70.5  0.000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.393297  normal  0.613719 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1383  hypothetical protein  38.78 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2510  XRE family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 109 aa  68.6  0.00000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.782316  normal  0.106202 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1135  transcriptional regulator, XRE family  38.24 
 
 		 114 aa  68.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00125994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  46.53 
 
 		 105 aa  67.8  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0917  XRE family transcriptional regulator  38.54 
 
 		 109 aa  62.8  0.000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2925  hypothetical protein  39.22 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0944333  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2260  XRE family transcriptional regulator  37.21 
 
 		 91 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.237375  normal  0.775485 
 
 
-
 
NC_011723  PCC8801_4541  transcriptional regulator  36.08 
 
 		 109 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  normal  1  normal  0.800191 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1046  hypothetical protein  38.16 
 
 		 277 aa  58.2  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3690  XRE family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 108 aa  57.8  0.00000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  39.51 
 
 		 94 aa  53.9  0.0000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  34.41 
 
 		 95 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0997  hypothetical protein  34.48 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.293899 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0731  hypothetical protein  33 
 
 		 111 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0267154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  39.47 
 
 		 94 aa  48.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0069  XRE family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00141281  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7058  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 104 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  36.99 
 
 		 93 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  40.62 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 93 aa  43.9  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  37.33 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 93 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  36.36 
 
 		 94 aa  42.7  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  32.39 
 
 		 94 aa  42.7  0.002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1304  hypothetical protein  33.85 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0120517  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  27.78 
 
 		 93 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  32.39 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  35.62 
 
 		 93 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>