52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene XfasM23_1039 on replicon NC_010577
Organism: Xylella fastidiosa M23



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 93 aa  189  1e-47  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  81.72 
 
 		 93 aa  159  1e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  158  3e-38  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  79.57 
 
 		 93 aa  155  3e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  76.92 
 
 		 94 aa  150  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  81.4 
 
 		 89 aa  147  5e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  74.19 
 
 		 93 aa  146  8e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  73.12 
 
 		 93 aa  142  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 93 aa  136  1e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  69.89 
 
 		 93 aa  133  9e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  68.54 
 
 		 93 aa  128  3e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  67.42 
 
 		 93 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  59.78 
 
 		 95 aa  119  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  52.33 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  52.33 
 
 		 96 aa  102  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  49.46 
 
 		 94 aa  100  7e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  51.19 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  53.49 
 
 		 93 aa  95.9  2e-19  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27820  hypothetical protein  53.49 
 
 		 95 aa  92  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  47.89 
 
 		 72 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  45.83 
 
 		 94 aa  68.9  0.00000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  43.21 
 
 		 92 aa  65.1  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1558  hypothetical protein  41.67 
 
 		 95 aa  63.5  0.0000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101581 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  73.68 
 
 		 95 aa  62  0.000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1358  helix-turn-helix domain-containing protein  40.85 
 
 		 94 aa  58.9  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2770  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 115 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1141  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.328884  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0402  hypothetical protein  32.61 
 
 		 93 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.782427  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3745  XRE family transcriptional regulator  31.87 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0603031  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4450  XRE family transcriptional regulator  29.17 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2999  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 111 aa  45.8  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.749674 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1130  transcriptional regulator, XRE family  33.82 
 
 		 109 aa  45.4  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0843  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 112 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.107177  normal  0.529462 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2814  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 113 aa  45.1  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.500947  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0723  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 110 aa  45.1  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.474185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4385  hypothetical protein  38.1 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3975  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0868503 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4189  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4238  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4132  transcriptional regulator, XRE family  31.94 
 
 		 113 aa  45.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4297  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0483  transcriptional regulator, XRE family  34.29 
 
 		 105 aa  44.3  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0994  hypothetical protein  38.1 
 
 		 137 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.679627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3843  XRE family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 112 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4303  XRE family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.958774 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0293  hypothetical protein  32.93 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000404115  normal  0.251611 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0276  Cro/CI family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 107 aa  42  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123998 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5345  hypothetical protein  40.82 
 
 		 57 aa  41.2  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0931  hypothetical protein  31.15 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0970466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0935  XRE family transcriptional regulator  30 
 
 		 107 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.438859  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3587  XRE family transcriptional regulator  39.58 
 
 		 105 aa  40.4  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.400871  normal  0.443277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>