23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1887 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1887  hypothetical protein  100 
 
 
95 aa  196  9e-50  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1109  transcriptional regulator, XRE family  75.61 
 
 
93 aa  67.8  0.00000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4348  hypothetical protein  71.43 
 
 
93 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.229274  normal  0.60758 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2102  hypothetical protein  65.22 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3840  hypothetical protein  66.67 
 
 
93 aa  65.5  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.12776  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0118  XRE family transcriptional regulator  65.31 
 
 
94 aa  64.7  0.0000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3517  XRE family transcriptional regulator  65.22 
 
 
93 aa  64.7  0.0000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1039  hypothetical protein  73.68 
 
 
93 aa  62  0.000000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0182  transcriptional regulator, XRE family  56.6 
 
 
89 aa  60.1  0.000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0745  XRE family transcriptional regulator  58.7 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.442536  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1226  XRE family transcriptional regulator  58.7 
 
 
93 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.665684  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4335  XRE family transcriptional regulator  61.9 
 
 
93 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.827532  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1109  XRE family transcriptional regulator  59.52 
 
 
93 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.814199  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1199  XRE family transcriptional regulator  57.78 
 
 
93 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0441621  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0026  hypothetical protein  53.66 
 
 
95 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000862843  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3970  transcriptional regulator  47.83 
 
 
72 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1581  hypothetical protein  50 
 
 
94 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89904  normal  0.044481 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0997  putative DNA-binding protein  52.78 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1024  XRE family transcriptional regulator  52.5 
 
 
93 aa  45.1  0.0003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3000  putative DNA-binding protein  52.78 
 
 
96 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.214867 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0549  transcriptional regulator, XRE family  52.38 
 
 
94 aa  44.7  0.0004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5524  helix-turn-helix domain-containing protein  48.89 
 
 
92 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.280888  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3475  hypothetical protein  46.15 
 
 
103 aa  43.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0241764  normal  0.020416 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>